СТРАТЕГИЯ ПОИСКА ГЕНОВ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ O Подготовила: Буркина Наталья O Постгеномная информатика достигла серьезных успехов в реконструкции генных сетей и изучении их интеграции при многих нормально протекающих метаболических процессах. К сожалению, скудность информации о генах, ассоциированных даже с частыми МФЗ, существенно затрудняет и делает невозможным полную реконструкцию соответствующих генных сетей. O В работах исследователей стратегия поиска генов предрасположенности строилась по следующему плану. O 1. Выбор наиболее вероятных генов-кандидатов на основании уже имеющихся данных по этиологии и патогенезу конкретного заболевания, основным метаболическим, биохимическим и функциональным нарушениям, вызванным патологическим процессом. O 2. Подбор функционально значимых аллелей соответствующих генов на основании анализа литературы и данных Интернета. O 3. Популяционный анализ частот аллелей и генотипов соответствующих генов. O 4. Сравнительный анализ аллельных частот и распределения генотипов соответствующих генов у больных с клинически верифицированным диагнозом болезни и у здоровых лиц той же популяции, подобранных по типу «случай-контроль». O Исследования должны проводиться на репрезентативных выборках пациентов и доноров (не менее 100 человек в каждой группе). O Естественно, что такой путь, будучи весьма длительным, трудоемким и дорогостоящим, в то же время не гарантирует, что выявленные аллельные различия являются главными в цепи патогенетических механизмов данного заболевания. O Картирование и идентификация генов-кандидатов проводятся либо на семьях высокого риска, имеющих больного, либо на группе неродственных пациентов с данной патологией O Исследование включает несколько этапов. O 1. Выявление локусов хромосом, обнаруживающих неслучайное сцепление с болезнью. O 2. Картирование с помощью SNP вне- или внутригенных участков, наиболее тесно сцепленных с заболеванием. O 3. Идентификация гена-кандидата с помощью компьютерной базы данных или методами молекулярного (физического) картирования («прогулка», «прыжки» по хромосоме). O 4. Сравнительный анализ аллельных частот и генотипов по соответствующим генам в популяции и у пациентов с данным заболеванием. O Предполагается, что в течение ближайших лет с помощью HapMap технологии удастся идентифицировать и оценить вклад отдельных генов и даже целых генных сетей в генез всех частых МФЗ. Это уже сделано в отношении диабета, остеопороза, некоторых форм рака, болезней глаз и других. O Еще более эффективным на современном этапе является метод общегеномного скрининга ассоциаций (Genome Wide Association Studies — GWAS), основанный на использовании программы HapMap в сочетании с техникой биочипов высокого разрешения. O К сожалению, эта революционная технология, насколько нам известно, пока недоступна в России. Изучение генома человека в отношении идентификации генов предрасположенности к заболеваниям (геновмаркеров) способствует развитию предиктивной медицины как инновационного направления, ставящего своей целью совершенствование дифференциального подхода в профилактике, диагностике и лечении наиболее частых мультифакториальных заболеваний на основании результатов генетического тестирования O . Современные методы генодиагностики (ПЦР и секвенирование) позволяют выявлять мутации, генетические полиморфизмы, которые в сочетании с неблагоприятными внешними факторами могут стать причиной формирования патологического процесса O Анализ генов-маркеров и генов их метаболических путей приводит к более детальному пониманию патогенетических механизмов ряда заболеваний. Применение основанного на геномике предсказательного подхода позволяет предупредить развитие болезни (в отличие от диагностики уже развернутой патологии), что способствует снижению заболеваемости, инвалидности, смертности от мультифакториальных заболеваний
