А.М. Шимкевич, Н.В. Луханина, О.Г. Давыденко

реклама
НАЦИОНАЛЬНАЯ АКАДЕМИЯ НАУК БЕЛАРУСИ
ИНСТИТУТ ГЕНЕТИКИ И ЦИТОЛОГИИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
КУЛЬТИВИРУЕМЫХ В БЕЛАРУСИ
СОРТОВ ЯЧМЕНЯ С
ПРИМЕНЕНИЕМ SSR АНАЛИЗА
А.М. Шимкевич, Н.В. Луханина, О.Г. Давыденко
Требования к методу
молекулярного маркирования:
-повторяемость и воспроизводимость данных, в том
числе, в различных лабораториях
- высокая разрешающая способность
- возможность создания баз данных
- доступность методики
Достоинства и недостатки основных молекулярных маркеров
(по Collard et al., 2005; Powell et al., 1995)
Маркер
Достоинства
Недостатки
RFLP
Ясность, надежность,
воспроизводимость
Уровень выявляемого
полиморфизма ограничен
RAPD
Простота, относительная
дешевизна, возможность
анализировать несколько
локусов, небольшое
количество ДНК
Результаты плохо
воспроизводимы
SSR
Простота, небольшое
количество ДНК, высокая
воспроизводимость
Обычно необходимо проведение
электрофореза в
полиакриламидном геле
AFLP
Множество локусов, высокий
уровень полиморфизма
Требует большого количества
ДНК, сложная методика
Микросателлитные маркеры, используемые в работе (по Ramsay et al., 2000)
№
Праймер
Последовательность (5'->3')
Хромосома
1
Bmac 0093
F- CGTTTGGGACGTATCAAT
R-GGGAGTCTTGAGCCTACTG
2H
2
Bmac 0163
F- TTTCCAACAGAGGGTATTTACG
R-GCAAAGCCCATGATACATACA
5H
3
Bmag 0007
F- TGAAGGAAGAATAAACAACCAACA
R- TCCCCTATTATAGTGACGGTGTG
7H
4
Bmac 0156
F- AACCGAATGTATTCCTCTGTA
R- GCCAAACAACTATCGTGTAC
7H
5
HVM 68
F- AGGACCGGATGTTCATAACG
R- CAAATCTTCCAGCGAGGCT
4H
6
Bmag 0507
F- CAACTAGCATACCCAAGCTATA
R-ACCCCTATTTCAATAATGGA
7H
7
Bmag 0603
F- ATACCATGATACATCACATCG
R-GGGGGTATGTACGACTAACTA
3H
8
EBmac 0701
F- ATGATGAGAACTCTTCACCC
R- TGGCACTAAAGCAAAAGAC
4H
9
HVC MA
F- GCCTCGGTTTGGACATATAAAG
R- GTAAAGCAAATGTTGAGCAACG
7H
10
HVM 74
F- CAGGAAGTCATTGCGTGAG
R- TGATCAAGAATGATAACATGG
6H
11
Bmag 0223
F- TTAGTCACCCTCAACGGT
R- CCCCTAACTGCTGTGATG
5H
12
Bmag 0606
F- TATTTGTAATGTATGTATGTCCC
R- TCATTGGTCCAGATAATACAA
3H
13
Bmac 0316
F- ATGGTAGAGGTCCCAACTG
R-ATCACTGCTGTGCCTAGC
6H
Результаты детектируются на приборе
Applied Biosystems Genetic Analyzer 3500
Условные обозначения используемых маркеров
Название маркера
Условное обозначение
Bmac 0163
A
Bmac 0156
B
EBmac 0701
C
Bmag 0507
D
Bmag 0603
E
Bmag 0606
F
HVM 68
G
Bmac 0316
H
HVM 74
I
Bmac 0093
J
Bmag 0007
K
HVC MA
L
Bmag 0223
M
Результаты SSR-анализа сортов ячменя
Название сорта
Формула генотипа
Талер
A147B170C146D148,150E118F150G196H171,190I195J163
Сталы
A145B170C148D146,148E135F150G196H165I195J163
Антьяго
A145B170C148D150,154E118F150G196H131I197J163
Тюрингия
A147B140C146D115E118F125G209H13I197J163
Сябра
A145B170C148D148E118F150G216H131I197J163
Гонар
A145B140C138,150D148,150E118F150G199H163I197J161
Атаман
A145B170C138D148E118F150G216H131I197J149,157
Дзiвосны
A145B170C146D148E118F150G223H165I195J167
Стратус
A145,147B140C146D148E135F123G216H163I197J163
Якуб
A145B170C148D148E118F150G209H163I197J157
Гастинец
A147B170C150D148E118F123G196H131I205J159
Бурштын
A145B170C146,148D148E118F125G209H193I197J157
Зазерский
A145B140C146D148,154E135F150G216H131I195J159
Бацька
A154B155C153D153E123F125H127I191J160
Фэст
A152B171C120,151D151E123F149H160I201J160
СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ!
Скачать