Взрыв мозга и легочная гипертензия: как

Взрыв мозга и легочная гипертензия: как
студент-айтишник помогает лечить людей
Своевременная диагностика нередко становится едва ли не главным условием эффективной
медицинской помощи, но, если врач лечит не больного, а болезнь, шансы на успех
значительно снижаются. Решить эту проблему призваны персонифицированная медицина и
системы поддержки принятия решений, над которыми работают специалисты Университета
ИТМО. Магистрант кафедры высокопроизводительных вычислений Илья Семов рассказал в
интервью нашему порталу о том, как помочь врачу вовремя обнаружить опасное
расстройство и почему он начал работать над созданием информационных систем для нужд
медицины.
Над чем именно ты работаешь в Университете ИТМО?
Если описывать максимально широко, то это трансляционная медицина – область, в
которой мы пытаемся привнести в медицинскую практику средства из мира
информационных технологий, физики, приборостроения. Берем весь технологический
багаж, который наработан человечеством, и начинаем применять во всевозможных
отраслях. На базе Университета ИТМО совместно с медицинским исследовательским
центром имени Алмазова работает Институт трансляционной медицины, мы с коллегами
разрабатываем проекты, конечная цель которых – создание систем поддержки принятия
решений. Мы используем медицинские данные, чтобы извлекать из них знания, которые
помогают врачам принимать решения о дальнейшем лечении пациентов – на основе
разрозненных данных и собственного опыта создаем информационные системы, с
которыми будут работать медики.
В октябре на конференции по трансляционной медицине специалисты вашей кафедры
показывали модель передвижения карет «скорой помощи», на основе которой можно
выбирать, в какую клинику лучше везти больного. Речь идет о таких системах?
Конкретно моя работа посвящена диагностике легочной гипертензии. Это не какое-то
конкретное заболевание, а целый класс очень неприятных состояний, при которых в легких
повышается сосудистое сопротивление. За счет этого увеличивается нагрузка на сердце,
оно быстрее «изнашивается», что, в свою очередь, ведет к целому спектру патологий.
Выявлять легочную гипертензию необходимо как можно раньше, чтобы у врача было
больше возможностей эту ситуацию исправить.
Сейчас я работаю с данными по эхокардиографическим исследованиям пациентов за
последние несколько лет. Это, по сути, электронные медицинские карты, которые иногда
поступают в очень плохом и нечитаемом состоянии, потому что врач может, допустим,
заполнять результаты в спешке. Я извлекаю из этих данных знания непосредственно по
эхокардиографии, чтобы структурировать, получить набор определенных параметров и по
ним отобрать тех пациентов, у которых есть легочная гипертензия. Мы планируем, что
потом к делу снова подключатся врачи, вместе с которыми мы создадим систему и обучим
её автоматически распознавать людей с гипертензией: после каждого
эхокардиографического исследования она должна определять, находится ли человек в
группе риска или нет, стоит ли его отправлять на дообследование или отпустить домой.
Как это будет выглядеть? Систему внедрят в электронный документооборот, это будет
какой-то информер или что-то иное?
Бывает, что системы поддержки принятия решений работают именно так, но наш проект
несколько сложнее. Он будет способен работать с более широким кругом заболеваний и
состояний, которые исследуют мои коллеги, например с артериальной гипертензией,
острым коронарным синдромом. Разные подгруппы занимаются разными расстройствами,
потому что для каждого из направлений нужны свои подходы, а количество болезней, с
которыми мы работаем, будет постепенно расти.
Мы пока не определились, как это будет выглядеть на интерфейсном уровне. Вариантов
конечной реализации множество: это может быть какой-то сервер, к которому подключен
планшет врача, мобильное приложение или десктопное, что-нибудь очень простое или,
наоборот, сложное. Само понятие «система поддержки принятия решений» можно
трактовать достаточно широко – что ты в него вложишь, с тем и придется работать. А
«золотого стандарта» медицинской системы поддержки принятия решений не существует,
эта область динамично меняется, в ней постоянно появляется что-то новое. В конце
концов, в каждой клинике свои условия и свои требования. В моей семье четыре человека
с медицинским образованием, и большую часть детства я провел в больнице – не потому
что болел, а «за компанию». Поэтому я знаю, что любая больница – это уникальный
организм, и есть огромное количество нюансов, которые нужно учитывать.
Согласно нашей идее, это будет система для персонифицированного подхода к пациенту.
Мы хотим отойти от обычного принципа, когда пациенты – просто группа людей с
одинаковой болезнью, и сместить внимание от общей статистики к конкретному
индивидууму. Лечение будет строиться на основе данных о твоих физиологических
параметрах, анамнезе – чем, когда, как и почему ты болел. И ты уже не один из многих, а
уникальный пациент – такое лечение гораздо эффективнее.
До магистратуры на кафедре высокопроизводительных вычислений ты изучал медицину?
Нет, в бакалавриате я учился по специальности «Информатика и вычислительная
техника», причем не в Петербурге, а в краснодарском Политехе – Кубанском
государственном технологическом университете. Сюда я приехал на четвертом курсе,
когда думал о том, где хочу учиться дальше, связывался с руководителями кафедр и
договаривался о встречах. В Университете ИТМО со мной общалась Клавдия Боченина,
научный сотрудник НИИ наукоемких компьютерных технологий и лаборатории «Городская
информатика». Уже после того, как я вернулся обратно в Краснодар, она написала мне в
Skype, что в апреле НИИ НКТ проводит Весеннюю школу-практикум молодых ученых и
специалистов, на которой можно выступить со своим докладом или же поучаствовать в
олимпиаде и побороться за право поступить на магистерскую программу без экзаменов. Я
взял с собой товарища и приехал в Петербург.
Что именно происходит в рамках Весенней школы?
Компетентно я могу говорить только о той, в которой принял участие, потому что каждый
год тема и содержание школы меняются. В 2014 году она была посвящена Big Data. Я на
тот момент научной деятельностью активно не занимался – мне всегда было это
интересно, но по сравнению с Петербургом в Краснодаре очень мало науки. Все проекты, с
которыми я там сталкивался как студент, либо были на уровне курсовых работ, которые
здесь пишут второкурсники, либо не находили поддержки со стороны преподавателей.
Например, моя знакомая в Краснодаре сейчас тоже сотрудничает с медиками. Она
работает над системой распознавания образов для офтальмологов, которая учится
отслеживать какую-то динамику на снимках глазного дна, и для этого нужны элементы
искусственного интеллекта. Но в ее вузе нет никого, кто мог бы помочь в этой области,
быть, что называется, science advisor. Конечно, в Краснодаре есть продвинутые отрасли,
но их спектр ограничен, а тем, что тебе неинтересно, заниматься сложно. Поэтому
какого-то своего исследования или доклада у меня на тот момент не было, и я сделал
основной упор на олимпиаду. Она была составлена по материалам мастер-классов, и, хотя
мой товарищ раньше в Петербурге не был, по городу мы почти не гуляли. Вечером после
школы возвращались в общежитие на Вяземском и до поздней ночи разбирали то, что
услышали за прошедший день, и в итоге оба получили право поступить в магистратуру без
экзаменов.
Для меня Весенняя школа НИИ НКТ была в каком-то смысле «взрывом мозга»,
возможностью оценить все многообразие того, что существует в области информационных
технологий. Большая проблема регионов в том, что на периферии профессиональный
мирок очень мал. Допустим, ты работаешь или учишься в сфере IT, и для тебя она
сводится к разработке мобильных и десктопных приложений для бизнеса. Но, когда ты
приезжаешь сюда, у тебя разбегаются глаза, ты видишь, что люди делают какие-то
невообразимые вещи. Мне кажется, это главный положительный эффект таких
мероприятий. Они дают возможность выбраться из закрытой системы и увидеть, насколько
мир большой и как много в нем интересного.
Беседовал Александр Пушкаш,
Редакция новостного портала Университета ИТМО
Дата публикации 19.02.2016
>>>Перейти к новости
>>>Перейти ко всем новостям
>>>Перейти на портал Университета ИТМО