Генетические основы регуляции развития растений фитогормонами изменение вектора силы тяжести, вектора освещения Ауксины («гормоны направлений») источники минерального питания Цитокинины («гормоны деления клеток») свет, температура Гиббереллины (стимуляторы вегетативного и генеративного развития ) механические повреждения дефицит воды, снижение концентрации гиббереллинов, цитокининов и ауксинов изменение вектора роста органов формирование новых побегов прорастание, рост, цветение Этилен («гормон стресса») защитные реакции, старение, ПКС АБК («гормон покоя») защитные реакции, ингибирование вегетативного развития Цитокинины Функции цитокининов: • На уровне клетки: 1. Контроль клеточного цикла на переходе G1-S 2. Стимуляция развития хлоропластов 3. Стимуляция транспорта питательных веществ в клетку • На уровне организма: 1. Поддержание апикальной меристемы побега 2. Ингибирование апикальной меристемы корня 3. Снятие апикального доминирования 4. Замедление старения листьев Натуральные цитокинины – производные аденина (Z) Транс-зеатин Цис-зеатин Дигидрозеатин Изопентениладенин Кинетин 6-бензиламинопурин Тидиазурон Биосинтез цитокининов Основные ферменты: 1. 3 1 4 2 2. 1 3 4 3. 4. изопентенилтрансферазы (IPT) синтез IP-нуклеотидов – тРНК-изопентенилтрнасфе-разы (tRNA-IPT) – синтез пренил-тРНК из тРНК цитохром Р450-монооксигеназы (CYP735A) – синтез Z-нуклеотидов из IP-нуклеотидов нуклеотидазы – синтез IP- и Zрибозид-монофосфатов из трифосфатов 5 5. нуклеозид-монофосфатгидролазы (LOG) – синтез активных цитокининов из цитокининнуклеотидов Тканеспецифичность экспрессии некоторых генов AtIPT: в корне AtIPT7 – эндодерма зоны элонгации корня AtIPT1 – предшественники ксилемы в прокамбии AtIPT3 – флоэма, молодые сосуды и перицикл. AtIPT5 – кончик корня и зачатки боковых корней Биосинтез цитокининов Основные ферменты: 1. 3 1 4 2 2. 1 3 4 3. 4. изопентенилтрансферазы (IPT) синтез IP-нуклеотидов – тРНК-изопентенилтрнасфе-разы (tRNA-IPT) – синтез пренил-тРНК из тРНК цитохром Р450-монооксигеназы (CYP735A) – синтез Z-нуклеотидов из IP-нуклеотидов нуклеотидазы – синтез IP- и Zрибозид-монофосфатов из трифосфатов 5 5. нуклеозид-монофосфатгидролазы (LOG) – синтез активных цитокининов из цитокининнуклеотидов Цитокинин-активирующие ферменты LOG • LOG фосфорибогидролазы осуществляют синтез свободных изопентениладенина (IP) и зеатина (Z) из изопентенили зеатин-монофосфатов (IPRMP и ZRMP), промежуточные стадии – изопентенил-рибозид и зеатин-рибозид (IPR и ZR) – основные транспортные формы цитокининов •Основное место экспрессии генов LOG – апикальная меристема побега • Мутанты риса log (lonely guy) имеют низкую жизнеспособность и сниженное количество латеральных органов Катаболизм цитокининов • Субстраты цитокинин-оксидаз – свободные цитокинины (зеатин, IP) и их рибозиды • Экспрессия генов AtCKX индуцируется цитокининами • Белки AtCКX локализованы в вакуолях и ЭР • Повышение экспрессии генов AtCKX вызывает снижение жизнеспособности, увеличение размеров меристемы корня и уменьшение апикальной меристемы побега Wild type 35S::AtCKX1 WT 35S::AtCKX 1, 2, 3, 4 Транспорт цитокининов 2. ZR, IP, ZOG 1. ZR, ZMP, Z, iPMP, iPA, iP Транспорт между органами растения: 1. Ксилемный транспорт. Основная транспортная форма - зеатин-рибозид. От корня к стеблю. 2. Флоэмный транспорт. Свободные цитокинины и гликозиды. В обоих направлениях. Транспорт между клетками: 1. Белки PUP свободные цитокинины (Z, IP) 2. Белки ENT цитокининрибозиды (ZR, IPR) PUP ENT Передача сигнала при ответе на цитокинины Основные компоненты: 1. Рецепторы – гибридные сенсорные гистидинкиназы (семейство АНК) (Arabidopsis hybrid-type Histidine sensor Kinases) 2. Гистидинфосфопереносящие белки (семейство АНР) 3. Транскрипционные факторы ARR-B 4. Репрессоры ответа на цитокинин ARR-A (гомологи ARR-B) Фенотипы мутантов по генам цитокининовых рецепторов А А – фенотип взрослых растений – резкое снижение жизнеспособности у двойных и тройных мутантов В – нечувствительность к высоким концентрациям цитокининов у тройных мутантов В Гистидин-фосфопереносящие белки (AHP) 1. Выполняют функцию челноков между цитоплазмой и ядром 2. Транспортируются в ядро после восприятии цитокинина рецепторами 3. Передают фосфатную группу от рецепторных гистидинкиназ на регуляторы ответа 4. У арабидопсиса выявлено 6 генов AHP (AHP1 – AHP6), которые экспрессируются во всех органах 5. Мутанты ahp1ahp2aph3ahp4 нечувствительны к цитокининам Регуляторы ответа на цитокинин (ARR) ARR А-типа ARR 1, 2, 10, 11, 12, 13, 14 функция неизвестна Вариабельный домен (?) репрессия ответа на цитокинины ARR B-типа ARR 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 15 транскрипционные факторы GARP домен (ТФ) регуляция экспрессии генов Регуляторы ответа на цитокинин ARR (G/A)GGAT(T/C) Цитокинин-регулируемые гены С помощью метода Microarray было обнаружено изменение уровней экспрессии более чем тысячи генов в ответ на обработку цитокинином БАП у растений арабидопсиса дикого типа и трансгенных растений 35S::CKX1 -Повышение экспрессии Клеточный цикл: CycD3-1, CycD3-2, CycD3-3 (циклины класса D) -Снижение экспрессии Развитие меристем: Синтез сахарозы и крахмала: KNAT1, KNAT2, STM APETALA2 (Гомеодоменсодержащие транскрипционные факторы) SUS (сахарозосинтаза) INV (инвертаза) STP (Н+ моносахаридный симпортер) Метаболизм и сигналинг цитокининов: Метаболизм и сигналинг ауксинов: PUP4 (переносчик) AHK2, CRE1 (рецепторы) ARF8 (транскр. фактор) EIR1/PIN7 (efflux-канал) CKX5 (цитокинин-оксидаза) ARR 4, 5, 6, 7, 8, 9, 15 (репрессоры ответа) APRR 5, 7 (псевдорегуляторы ответа) GH3 (синтез коньюгатов) IAA3 (репрессор ответа) AUX1 (influx- канал) KAT1 (калиевый ионный канал) Метаболизм и сигналинг этилена: ACS 6, 8, ACX 5 (биосинтез) ETR2, ERS2 (рецепторы) EIN3, ERFs (транскр. факторы) Метаболизм и сигналинг гиббереллинов: GA-20-Ox, GA4 (биосинтез) GAI, RGA, SPY (репрессоры сигнала) Цитокинин-регулируемые гены Световой сигналинг: PHYA (фитохром А) PKS1 (субстрат фитохромов А и В) PAT1 (позитивный регулятор) Функции хлоропластов: Pet A NIA1 (нитрат-редуктаза) (цитохром гамма) NRT2-1, 2-2, 2-3 (переносчики Psb A, G нитратов) (белки фотосистемы 2) AMT 1-2, 1-3 (переносчики matK (сплайсинг аммония) хлоропластной РНК) SULTR 1-1, 1-2 (переносчики сульфатов) PHT 1, 2 (переносчики фосфатов) Транспорт неорганических солей: стимуляция развития придаточных корней развитие проростка («тройной ответ») Устойчивость к биотическим и абиотическим стрессам ЭТИЛЕН С2 Н4 старение и опадение листьев созревание плодов Биосинтез этилена * Промежуточные продукты: МЕТ (метионин), AdoMet (S-аденозил-метионин), ACC (1-аминоциклопропан-1-карбиоксиловая кислота) Побочный продукт: МТА (метилтиоаденин) – превращается обратно в МЕТ через цикл Янга Ферменты: AdoMet-синтаза, ACS (АСС-синтаза), ACO (АСС-оксидаза) * - Лимитирующая стадия – синтез АСС из AdoMet. Регулируется: 1). через экспрессию генов АСS – ауксинами, брассиностероидами, поранением 2). через стабильность белков АСS (основной путь) - цитокининами Передача сигнала при ответе на этилен Основные компоненты: 1. Рецепторы этилена: ETR1 и 2, ERS1 и 2, EIN4 2. Компоненты МАР-киназного каскада: CTR1, MKK9, MPK3 и 6 3. Металлотранспортер EIN2 4. Транскрипционный фактор EIN3 5. Компоненты убиквитинлигазного комплекса EBF1 и 2 6. 5’-3’-экзорибонуклеаза EIN5 7. Транскрипционные факторы ERF Взаимодействие белков, входящих в 2хкомпонентные системы передачи сигналов у Arabidopsis: Гибридные гистидин-киназы CRE1 и CKI (рецепторы цитокинина), а также ETR1 (рецептор этилена) могут передавать фосфатную группу на фосфотрансферазы AHP1 и AHP2 активация регуляторов ответа на цитокинин ARR2 и ARR4. подавление развития ПАМ ауксины формирование андроцея цитокинины Гиббереллины АБК ауксины прорастание семян этилен удлинение междоузлий, листьев, корней этилен АБК переход к цветению Биосинтез гиббереллинов Основные ферменты: 1. Семейство TPS (терпенсинтазы) – до энткаурена: - CPS (копалил-дифосфатсинтаза) - KS (энт-каурен-синтаза) 2. Семейство P450монооксигеназ – до GA12: - КО (энт-каурен-оксидаза) - КАО (оксидаза энткауреновой к-ты) 3. Семейство 2ODD (2оксоглютаратзависимые диоксигеназы) – до GA1, GA3, GA4: - 20ох (GA-20-оксидазы) и 3ох (GA-3-оксидазы) – синтез активных GA - 2ох (GA-2-оксидазы) – инактивация GA Основной путь регуляции концентрации гиббереллинов - контроль экспрессии генов 2ODD (Ga3Ox, Ga20Ox активаторы, Ga2Ox - инактиваторы) Рецепция и передача сигнала при ответе на гиббереллины SCFSLY/GID2 3 1 2 4 Абсцизовая кислота (АБК) «гормон покоя», «гормон засухи», антагонист гиббереллинов, ауксинов, цитокининов терпеноиды - АБК +АБК Биосинтез АБК Основные ферменты: в пластидах в цитозоле 1. зеаксантин-эпоксидазы (ZEP) синтез виолоксантина из зеаксантина 2. ликопен-циклазы-b (LCYB, NSY) – синтез неоксантина из виолоксантина 3. N-цисэпоксикаротеноиддиоксигеназы (NCED) – синтез ксантоксина из цис-неоксантина 4. АБК-альдегидоксидазы (АВА2, ААО3) – синтез АБК из ксантоксина через АБК-альдегид Регуляция экспрессии генов биосинтеза АБК Контроль на уровне сплайсинга РНК: SAD1 (Supersensitive to ABA and Drought) – Белок семейства SnRNP Рецепция и передача сигнала АБК ядро репрессия цветения FLC FCA ??? хлоропласты АБК CHLH ??? плазмалемма GPCR PLDa ABI3 (GCR2, GTG1/2) ??? созревание зародыша, период покоя цитозоль RCAR ! PP2C SnRK2 ABI5 защита от высыхания Четыре независимых рецептора запускают независимые пути передачи сигнала для реализации разных программ развития !