МАТРИЧНОЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЕ СИСТЕМЫ ГЕНЕТИЧЕСКОГО

реклама
1
«
,
. XXI
”(
.
. .
)–
, 2006, .216-250 (
).
. .
petoukhov@hotmail.com , http://www.petoukhov.narod.ru
“…
–
(
,
,
)
”
,
.
.
,
,
,
.
,
,
,
.
–
–
.
Genbank
,
«
?
:
,
,
.
,
,
,
«
». …
» [
, 1999, . 14].
.
,
.
.
,
,
,
.
.
,
,
)
(
,
.
,
,
,
,
,
,
.
2
,
.
«
»
,
.
,
.
.
,
–
–
.
,
.
.
,
,
.
.
,
,
.
,
,
,
–
.
–
–
–
,
,
,
.
.
,
,
«
(
. 1):
»,
«
( ),
( ),
( )).
(
(G),
»
(U) (
)
.
-G
A-U,
.
. 1.
:
3
-
(
),
-G(
–
.
N–
).
,
,
–
O–
,
.
.
,
,
(
)
.
,
(
),
.
20
40 000
.
,
,
,
.
.
,
(
).
.
43 = 64
,
20
.
,
64
,
20
,
,
-
–
.
n
(
,
)
3n
,
,
3n-
.
.
–
64
.
.
.
.
(
. 2). ,
,
P(n),
(
(
)
,
n
,
).
,
.
(n)
“n”
,
,
,
:
.
,
,
n-
(n-1)
,
, U, G.
,
(n)
n-
,
(n)
(
).
(n)
“n”
,
(
«
»).
(n)
,
4
n-
,
.
,
.
1
0
1
(2)
=
0
U
G
111
CCC
CCU
CUC
CUU
UCC
UCU
UUC
UUU
111
110
101
(3)
P = 100
011
010
001
000
,
110
CCA
CCG
CUA
CUG
UCA
UCG
UUA
UUG
=
=
101
CAC
CAU
CGC
CGU
UAC
UAU
UGC
UGU
100
CAA
CAG
CGA
CGG
UAA
UAG
UGA
UGG
11
10
11
CC
CU
01
UC
00
UU
011
ACC
ACU
AUC
AUU
GCC
GCU
GUC
GUU
01
AC
AU
G
C
G
U
U
G
010
ACA
ACG
AUA
AUG
GCA
GCG
GUA
GUG
001
AAC
AAU
AGC
AGU
GAC
GAU
GGC
GGU
00
AA
A
G
G
A
G
G
000
AAA
AAG
AGA
AGG
GAA
GAG
GGA
GGG
(n)
. 2.
/
10
CA
C
G
UA
n = 1, 2, 3
, 2001/.
, , G, U.
,
,
[
, 2001; Petoukhov, 1999, 2001a].
,
U
,
G–
.
(
1,
U
),
0.
G–
(
),
(
):
1,
, -
,
0 (
).
. 2
.
–
.
,
,
101 (
,
),
–
110 (
,
).
.
AU
5
(3)
64
.
[Wittmann,
1961],
.
,
.
(n)
.
.
.
(
C=G=3, A=U=2),
.
P(n)
,
,
9664
6946
(2)
= 6496 ;
4669
32
(1)
= 23 ;
.
3 3 2=18.
(n)
(
.17.1):
P(3)
G
27 18 18 12 18 12 12 8
18 27 12 18 12 18 8 12
(3)
= 18 12 27 18 12 8 18 27
12 18 18 27 8 12 12 18
18 12 12 8 27 18 18 12
12 18 8 12 18 12 27 18
12 8 18 12 18 12 27 18
8 12 12 18 12 18 18 27
(n)
.17.1.
(n)
(3)
,
.
5n,
(n)
10n .
1000.
,
(C=G=3, A=U=2).
125,
,
3/2,
,
.
,
.17.1
,
27, 18, 12, 8
.
(n)
= (1+50.5)/2 = 1,618…
(n)
«
»
= (
MULT
,
(n) 1/2
MULT ) ,
(
.17.2).
(
2004, 2006; Petoukhov, 2001, 2005]).
)1/2 =
=
(P
=
-1
-1
.17.2.
(P
(n) 1/2
)
=
(3) 1/2
) =
=
(n)
;
)
=
(3)
=(
(2) 1/2
; (P
-
=
(2)
=
2
0
0
-2
0
2
-2
0
0
-2
2
0
-2
0
0
2
3
1
1
-1
1
-1
-1
-3
1
3
-1
1
-1
1
-3
-1
1
-1
3
1
-1
-3
1
-1
-1
1
1
3
-3
-1
-1
1
1
-1
-1
-3
3
1
1
-1
-1
1
-3
-1
1
3
-1
1
-1
-3
1
-1
1
-1
3
1
-3
-1
-1
1
-1
1
1
3
.
[
,
,
6
,
:
,
. (
-
,
,
…).
,
.
,
,
.
,
,
.
,
,
,
(
-
).
,
. . [
,
,
, 2004; Petoukhov, 2005].
.
(n)
.
.
.
.
(
C=G=3, A=U=2),
P(n)
.
.
(3)
,
3 3 2=18.
P
G
(n)
(3)
(3)
,
=
.
(
,
.3):
27
18
18
12
18
18
27
12
18
12
18
12
27
18
12
12
18
18
27
8
18
12
12
8
27
12
18
8
12
18
12
8
18
12
18
8
12
12
18
12
125
125
125
125
125
12
12
8
125
18
8
12
125
8
18
12
125
12
12
18
125
18
18
12
125
27
12
18
125
12
27
18
125
18
18
27
125
125
125
125
1000
(3)
. 3.
,
(C=G=3, A=U=2).
.
.
.
(n)
,
.
(n)
10n .
125,
.
,
1000.
(3)
(3)
512.
,
5n,
7
.
(n)
,
,
,
(
,
.).
,
.
:
-
,
,
,
.
,
.
= (1+50.5)/2 = 1, 618…
,
(n)
«
-1
+3
;
-3
(n)
»
(n)
:
(3)
1
(
.
64
,
-
(
.
+1
):
,
«
(n)
,
:
=
(3) 1/2
(
)
=
-1
1
-1
-1
-3
1
3
-1
1
-1
1
-3
-1
1
-1
3
1
-1
-3
1
-1
-1
1
1
3
-3
-1
-1
1
1
-1
-1
-3
3
1
1
-1
-1
1
-3
-1
1
3
-1
1
-1
-3
1
-1
1
-1
3
1
-3
-1
-1
1
-1
1
1
3
(3) 1/2
= (P
) ,
.
)1/2
.
-1
)1/2 =
; (P
=
G
1
.
3 2
2 3
,
1
(3)
(n)
,
3
. 4.
(
».
( .
. 2)
, A = U = -1.
-1
= .
=G=
P
(3)
(n)
.
(n)
(3)
=
)
3,
,
P
(n) 2
= (
. 4).
=
(2) 1/2
(P
-1
,
:
)
=
=
(2)
=
;
. 5.
(P
(n) 1/2
)
=
2
0
0
-2
0
2
-2
0
0
-2
2
-2
0
0
0
2
(n)
,
.
–
:
-
–
)
,
-1
(
P
,
8
(C=G=3, A=U=2)
.
:
,
,
,
-1
.
,
(
-1
).
–
.
–
-
.
,
.
,
,
[Petoukhov, 2001a].
–
,
,
.
+1
:
-1
-1
+3
+3
;
-3
, 2004].
[Petoukhov, 2001a, 2003;
(3) 1/2
(3)
(
) =
.
-3
,
.
,
.
,
+1
,
,
«69» (
,
. 6).
,
,
«69».
-1
. 6.
(
,
+1
)
(
)
,
,
,
,
-
(
(3)
.
(
) =
.
(3)
.
8, 12, 18
,
,
27
,
.
,
).
,
,
(3) 2
64
,
.
9
,
,
(
. 7).
X(a, b, c, d)
*
Y(k, m, p, q)
. 7.
=
Z(r, g, v, z)
(
)
,
,
,
,
,
. .
,
-
,
.
,
.
,
,
,
,
.
,
(n)
,
-1
2
0
0
-2
0
2
-2
0
?
-2
2
0
-2
0
0
2
1
1
-1
1
-1
-1
-3
1
3
-1
1
-1
1
-3
1
-1
3
1
-1
-3
1
-1
-1
1
1
3
-3
-1
-1
1
1
-1
-1
-3
3
1
1
-1
-1
1
-3
-1
1
3
-1
1
-1
-3
1
-1
1
-1
3
1
-3
-1
-1
1
-1
1
1
3
-1
….
-1
0
3
(n)
. 8.
(n)
n = 2, 3, 4, …
,
,
,
.
«
».
10
,
,
,
,
[Petoukhov, 2003].
.
(«
»
,
)
.
(3)
,
«96».
:
«69»,
–
«96».
,
,
,
: [sh x ch x ; ch x sh x] ((
,
,
,
Matlab).
,
[
-
, 2004 ].
,
,
,
[
, 1999].
(2 2)
.
i = (-1)1/2
,
:
i = Arch(1/(2* )) / arccos (1/(2* )) ; i = Arch[cos(0,4* )] / (0,4* ) ,
Arch
arc os –
(1)
.
,
.
«
»[
, 2003, . 255],
.
(
. 2)
,
,
.
,
,
.
,
,
,
(
Pi
=G=3, A=U=2
(
. 9).
i –
)
)(n).
(P
)(n),
(Pi
,
. 9.
,
-
,
,
(
0
i
-i
0
;
Pi =
C
iU
).
i
-iA
G
; Pi
3
=
- i
3
2i
- i
-2i
3
-
-1
; (Pi
)
- i
-
1/2
-1
=
,
)(n).
(Pi
=
i
-
-1
(
(
-3
-1
)i
-(
)i
-1
)i
11
- i
-( -3)i - -1
-1
3
-1
- -1
-( -3)i - i
(3)
-1
3
-3
-1
-1
= - i
i
i
( )i
))
-1
-1
-3
3
- i
- i
- -1
-( )i
i
-1
3
-1
- i
- -1
i
( -3)i
i
-1
-3
-1
-1
3
- i
( )i
i
i
3
- -1
- -1
-( -3)i - -1
i
i
i
3
i
i
(
i
-1
-1
- i
- i
. 9.
=G=3, A=U=2
.
(Pi
–
(
i
.
Pi .
) ,
).
i–
(
)
(
.
).
,
.
«
1914].
» [Cook,
-
,
-1
: 1/3*[
sin ; -sin
-1
;-
,
] = [cos
cos ].
72
(
0
.
0
36
)
:
= 10 * arcsin[1/(2* )]
= ( 10/3 ) * asin( /2) ;
,
i,
(2)
,
,
(
).
«
.
,
»,
, .
.,
(
)
«
»,
( .
[
, 1981]).
,
,
,
.
.
.
(3)
,
64
20
?
(3)
.
.
,
,
,
,
.
64
12
20
,
,
.
,
[
,
, 2001].
(3)
. 10
,
.
(3)
(2 2)
,
NN-
.
16
.
NN8
. 10,
.
,
NN-
,
.
.
NN-
,
,
–
,
(
«
»
).
«
»
P(3)
NN-
.
,
-
-
:
,
,
.
,
,
1-2, 3-4, 5-6, 7-8
.
111
110
101
100
011
010
001
000
.
111
110
101
100
011
010
001
000
CCC
Pro
63
CCU
Pro
55
CUC
Leu
47
CUU
Leu
39
CCA
Pro
62
CCG
Pro
54
CUA
Leu
46
CUG
Leu
38
CAC
His
61
CAU
His
53
CGC
Arg
45
CGU
Arg
37
CAA
Gln
60
CAG
Gln
52
CGA
Arg
44
CGG
Arg
36
ACC
Thr
59
ACU
Thr
51
AUC
Ile
43
AUU
Ile
35
ACA
Thr
58
ACG
Thr
50
AUA
Met
42
AUG
Met
34
AAC
Asn
57
AAU
Asn
49
AGC
Ser
41
AGU
Ser
33
AAA
Lys
56
AAG
Lys
48
AGA
Stop
40
AGG
Stop
32
UCC
Ser
31
UCU
Ser
23
UUC
Phe
15
UUU
UCA
Ser
30
UCG
Ser
22
UUA
Leu
14
UUG
UAC
Tyr
29
UAU
Tyr
21
UGC
Cys
13
UGU
UAA
Stop
28
UAG
Stop
20
UGA
Trp
12
UGG
GCC
Ala
27
GCU
Ala
19
GUC
Val
11
GUU
GCA
Ala
26
GCG
Ala
18
GUA
Val
10
GUG
GAC
Asp
25
GAU
Asp
17
GGC
Gly
9
GGU
GAA
Glu
24
GAG
Glu
16
GGA
Gly
8
GGG
13
Phe
7
Leu
6
. 10.
Cys
5
Trp
4
Val
3
Val
2
Gly
1
Gly
0
(3)
20
/
(2 2)
, 2001, . 99
106/. 20
Pro, His, Gln
.
-
“stop”.
,
NN-
,
,
,
.
0
NN-
63
.
20
(3)
,
8
12
.
(3)
20
,
.
.
20
64
.
17
Information (
,
«National Center for Biotechnology
)»: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi .
20
.
.
20
,
1
, . .
8
8.
,
Thr
4,
-
. .
20
1
1
3
8
4
8
1 2 3 4 5 6 7 8
1) The Vertebrate Mitochondrial Code
2) The Standard Code
3) The Mold, Protozoan, and Coelenterate
Mitochondrial Code and the Mycoplasma
/Spiroplasma Code
4) The Invertebrate Mitochondrial Code
5) The Echinoderm Mitochondrial Code
6) The Euplotid Nuclear Code
7) The Bacterial and Plant Plastid Code
8) The Ascidian Mitochondrial Code
9) The Flatworm Mitochondrial Code
10) Blepharisma Nuclear Code
2
1
2
2
2
2
2
12
9
10
12
8
8
9
12
7
8
1
1
2
2
1
3
2
6
5
5
2
3
3
6
6
5
5
5
6
5
1
1
3
3
3
1
3
1
1
1
12
12
12
8
8
8
12
12
12
12
12
12
12
8
8
8
8
8
8
8
14
11) Chlorophycean Mitochondrial Code
12) Trematode Mitochondrial Code
13) Scenedesmus obliquus mitochondrial Code
14) Thraustochytrium Mitochondrial Code
15) The Alternative Yeast Nuclear Code
16) The Yeast Mitochondrial Code
17) The Ciliate, Dasycladacean and
Hexamita Nuclear Code
2
1
2
2
2
2
9
10
9
9
9
13
8
1
1
1
1
1
5
6
5
5
5
5
6
1
2
1
1
2
1
1
3
1
1
1
. 11.
1
1
1
1
12
12
12
12
12
13
11
8
8
8
8
8
7
9
20
–
/
1
-
, 2001/).
(
1
(
4
(
3)
8).
,
–
.
,
,
.
,
.
,
.
,
17
.
,
,
,
20
-
(
1
4
. 11
1[
20
:
1
4
–
–
3),
8).
3)
(
8).
, 2004; Petoukhov, 2001] :
12
8
(
(
:
,
11:9
13:7.
12:8 (
,
,
20)
.
,
.
,
20
12
P(3).
. 10)
NNNN-
(
Ala, Arg, Gly, Leu, Pro, Ser, Thr, Val,
Asn, Asp, Cys, Gln, Glu, His, Ile, Lys, Met, Phe, Trp, Tyr
«
»
.
8 12
.
,
(
).
,
«
8
»
NN2:
,
15
,
,
,
.
UAG,
.
Leu
-
2
,
(
Gln,
,
,
),
(
-
. 10
).
,
17
,
.
:
-
,
–
.
,
,
,
.
,
8
(
-
20
12
).
.
1:
2:
8
4, 6, 8 -
12
24.
– 1, 2, 3,
,
24 (
5
17
7;
0,88 %).
:
,
12 (
24) [Petoukhov, 2001b].
,
.
,
24
24
,
,
,
24
.
,
«
»
,
»
,
«
-
,
.
24
,
.
,
,
.
24
[Petoukhov, 2001b;
(
24-
)
.
, 2004]:
16
.
,
,
.
(
«
» («
?)
»),
.
[Petoukhov, 2001b;
-
, 2004].
,
.
.
?
(«
»)
,
,
.
-
1:3
«
,
,
2:2
-
«
4:0
»
1:2:1.
»
2004 , ].
[
,
.
(
),
,
,
.
«
.
?
»
,
.
(
1:3,
)
-
,
.
:
.
(
)
,
. .
-
4:0.
:
).
,
(
3+1,
,
(
«
,
.
,
, 1998,
,
[
. 202]).
,
-
«
»,
»
,
: «
.
.
(
»[
, . 201].
),
17
,
3:1.
,
(
U (
).
3:1.
G-
, ,G
)
,
-
,
N17
,
. 10
-
.
,
N-
,
,
-
NN-
3:1
.
-
NN-
,
- 1:3
1:2:1.
2:2
-
17
NN-
4:0
1:1:1:1.
,
NN-
,
-
.
.
,
,
2:2
,
1:2:1)
4:0
(1:3
,
,
.
-
(
)
([
.
, 2004 ,
]).
,
,
.
-
,
,
.
,
.
(
.[
-
, 2004 , ]).
.
(
),
?
,
1:3
?
.
51
(
-
,
-
-
(21
ATG
,
- 52 = 4 13):
):
1GGC 2ATC 3GTT 4GAA 5CAG 6TGT 7TGC 8ACT 9TCT 10ATC 11TGC 12TCT 13CTT
14TAC 15CAG 16CTT 17GAG 18AAC 19TAC 20TGT 21AAC ;
18
-
-
(30
,
):
1TTC 2GTC 3AAT 4CAG 5CAC 6CTT 7TGT 8GGT 9TCT 10CAC 11CTC 12GTT 13GAA
14GCT 15TTG 16TAC 17CTT 18GTT 19TGC 20GGT 21GAA 22CGT 23GGT 24TTC 25T
TC 26TAC 27ACT 28CCT 29AAG 30ACT .
51
38 A-, C39
U),
(
-
EG13077
13 GATG
1:3.
Escherichia:
ATG-GTT-CAG-AAG-CCC-CTC-ATT-AAG-CAG-GGA-TAT-TCA-CTG-GCA-GAG-GAA-ATA-GCC-AACAGC-GTC-AGT-CAC-GGC-ATT-GGG-TTG-GTG-TTT-GGT-ATC-GTT-GGG-CTG-GTG-TTG-CTA-CTGGTT-CAG-GCG-GTG-GAT-CTT-AAT-GCC-AGC-GCC-ACA-GCG-ATA-ACC-AGC-TAC-AGC-CTC-TATGGC-GGC-AGT-ATG-ATC-CTG-CTG-TTC-CTC-GCT-TCG-ACG-CTC-TAT-CAC-GCC-ATT-CCT-CAT-CAACGG-GCA-AAA-ATG-TGG-CTG-AAG-AAA-TTT-GAC-CAT-TGC-GCT-ATT-TAC-CTG-TTG-ATT-GCCGGA-ACC-TAC-ACG-CCG-TTT-TTG-CTG-GTG-GGG-CTG-GAT-TCT-CCG-TTA-GCG-CGC-GGG-TTGATG-ATT-GTT-ATC-TGG-AGC-CTG-GCA-TTG-CTG-GGT-ATT-CTG-TTT-AAA-CTG-ACC-ATC-GCG-CACCGA-TTC-AAA-ATT-TTA-TCT-CTG-GTG-ACC-TAT-CTG-GCG-ATG-GGC-TGG-CTG-TCG-CTG-GTG-GTAATT-TAT-GAA-ATG-GCA-GTT-AAG-CTC-GCG-GCG-GGC-AGC-GTT-ACC-TTA-CTG-GCG-GTA-GGCGGC-GTG-GTT-TAT-CG-CTC-GGG-GTG-ATT-TTC-TAC-GTC-TGC-AAA-CGC-ATT-CCA-TAC-AAC-CATGCC-ATC-TGG-CAC-GGC-TTC-GTG-CTC-GGC-GGT-AGT-GTG-TGC-CAC-TTT-CTG-GCG-ATC-TATTTG-TAT-ATT-GGG-CAG-GCG-TAA
220
(
)
, 46 G,
-
55
(50 -
165
)
, 69
55:165=1:3.
,
-
N-
1:3.
«
»
.
,
.
,
,
.
20?
.
:
20
,
[Petoukhov, 2001b;
,
8
2004a].
:
12
,
8
20
12
?
,
,
.
-
12 = 4 3.
,
12 –
:8=4 2
8
3
2
.
8
,
12
.
-
–
.
,
–
,
8
12
,
.
?
20
,
.
19
.
«
,
,
-
»
20
8
12
.
,
8
-
,
,«
«
«
),
-
»
»
(
-
»
) (
2004c/).
12
(
, 2004; Petoukhov,
. /
,
20
,
-
.
,
8
12
-
2
3 (8=4 2
12=4 3)
. 12.
8 «
20
«
»
.
»
12
,
,
,
,
,
.
«
«
»
»
(
)
.
. 10
,
N-
.
,
N8=4
.(
.[
, 2004 , ]).
2
-
Pro, Arg
Phe, Tyr
Lys, Met
(C-
) (A-
(U-
)
Ala, Gly
)
(G-
)
20
12 = 4 3
-
. 12.
Gln, His, Leu
Asn, Ile, Thr
Cys, Trp, Ser
Asp, Glu,Val
(C-
(A-
(U-
(G-
)
20
(
)
)
)
)
8
12
.
-
,
N-
.
.
.
,
,
.
,
.
20
.
(
.
, [
, (Pi
)
(n)
,
.
(
)
i
(n)
, 1989, . 61]).
,
,
. 9)
(
,
, . .
,
.
,
,
.
.
,
,
,
-
.
,
.
.
,
.
,
.
.
,
[
(3)
, 2003, . 753].
. 2),
,
,
(
,
.
G, A, U)
4
64
( ,
.
,
(
)
-
;
,
[
, 2001].
:
(
U=G=0 (
«
C=U=1, A=G=0
= =1,
);
»);
C=G=1, A=U=0 (
(n)
).
n.
,
CGA
100;
– 110.
– 101;
(n)
,
n.
(n)
(n)
1,
(n)
2,
CC
n,
(n)
3,
CA
AC
(2)
AA
.
. 13
11 10 01 00
11 11 11 11
(2)
1,
(2)
2,
(2)
3
.
11 10 01 00
21
CU CG AU AG
11 10 01 00
10 10 10 10
10 11 00 01
UC UA GC GA ; 11 10 01 00 ; 01 01 01 01 ; 01 00 11 10
UU UG GU GG
11 10 01 00
00 00 00 00
00 01 10 11
(2)
. 13.
(2)
1,
-
(2)
2,
(2)
3
.
(n)
-
,
,
,
.
,
.
N-
(N)
(n)
1,
(n)
2,
(n)
3
.
(
N
)
(3n)
.
3n-
,
, . .
«
»
.
,
,
(n)
,
(
),
.
,
,
,
,
.
(3n)
(3)
,
.
,
,
,
.
.
«
».
.
1969
,
:«
,
3000
,
«
«
,
,
»
«
». … «
»
»
… .
«
»
» [G. Stent, 1969, .64].
,
,
,
.
,
,
,
««
»,
.
,
,
»[
, 1998, .92].
22
,
,
: «
,
.
»
«
» [F.Jacob, 1974].
,
.
.
,
–
(
,
1)
(
(
111
110
101
100
011
010
001
000
. 14.
(
( 11 )
( 10 )
( 01 )
( 00 )
111
110
101
100
011
010
001
000
111111
111110
111101
111100
111011
111010
111001
111000
110111
110110
110101
110100
110011
110010
110001
110000
101111
101110
101101
101100
101011
101010
101001
101000
100111
100110
100101
100100
100011
100010
100001
100000
011111
011110
011101
011100
011011
011010
011001
011000
010111
010110
010101
010100
010011
010010
010001
010000
001111
001110
001101
001100
001011
001010
001001
001000
000111
000110
000101
000100
000011
000010
000001
000000
«
)
»
64
«
2001].
. 14
0).
).
. 14,
»
-
[
(
).
, 1997;
64
, 1994;
, 1993;
,
,
0
1
.
,
,
(
«
»
«
,
»,
. .) [
,
, 1997, . 101].
«
»
,
.
,
(3)
(3)
[
, 2001].
.2
,
( . .
)
,
,
,
-
,
. 14,
.
,
,
«
».
,
,
23
,
.
.
(3)
3,
,
. 15].
[
, 1994,
, 2001, . 61]
[
2
(A=G=9, C=U=T=6).
,
144, 168, 168,
,
,
192, 168, 192, 192, 216.
«
,
»
12,
«
8
,
«
»[
, 2003, . 269-292].
…
.
12
,
8
12
12
8
8
.
.…
12
«
»» [
«
9 [
8
, 1994, . 39-40].
»
6, 7, 8
, 1997, . 22, 522].
,
(
:
6
NH2 – 9
,
),
N–7
, 2001].
,
[
6
–8
,
,
[
, 2001].
,
«
1:
»[
, 2002].
,
.
(n)
( .
. 2)
(C=G=3, A=U=2)
,
(n)
,
(3)
. 4, 5.
.
3.
(
,
(3)
. 15)
: 1)
,
,
:
CGA
2
2)
3
3
3
3
2
2
3
3
3
3
2
2
3
3
3
3
2
2
:
3
3
3
3
2
2
=1, 2,
1
–
=G=3, A=U=2.
2 2 2 2
2 2 2 2
2 2 2 2
2 2 2 2 ;
3 3 3 3
3 3 3 3
G,
3
3
2
2
3
3
3
3
2
2
3
3
2
2
3
3
2
2
2
2
3
3
2
2
3
3
2
2
3
3
3
3
3
2
2
3
3
2
2
3
3
2
2
2
2
3
3 ;
2
2
,
C,
A;
–
3
2
3
2
3
2
2
3
2
3
2
3
3
2
3
2
3
2
2
3
2
3
2
3
3
2
3
2
3
2
2
3
2
3
2
3
3
2
3
2
3
2
2
3
2
3
2
3
24
2 2 2 2 3 3 3 3
2 2 2 2 3 3 3 3
B1
2 2
2 2
3 3 2
3 3 2
B2
2 3
2 3
3
3
3
2
;
2 3
3 2
2 3 2
3 2 3
B3
;
1
2
. 15.
3 2
2 3
3
:
B1, B2, B3 ,
(3)
,
,
-1
=
C=G=3, A=U=2.
:
= (1 + 51/2)/2 = 1, 618…
2
(B ).
–2
.
3-
.
,
-1
=
= 1, 2, 3,
:
).
4
2
=
-1
.
(
.
«
,
. 15,
»
,
[
.
1
=
,
2
2
3
=
10.
1
,
3
-1
,
12
2:
(n)
8.
.
(n)
(n)
.
n
, 2003].
,
,
2-
,
(
)
«
»
1( ,
,
(n)
-1
.
)
2(
= [3 2; 2 3].
.
-1
,
,
),
,
,
.
.
,
,
.
,
,
.
,
,
,
25
.
,
,
,
.
,
.
2
3
-
,
.
,
9
,
6
.
,
(
http://us.geocities.com/symmetrion/)
(
. .
,
.
,
,
. .
,
-
,
, http://polaris.nova.edu/MST/ISSB).
. .
,
, .
, .
.
.
:
1.
2.
. .
. .
. – ., 2003.
. –
,
, 1981.
.«
3.
4.
5.
6.
7.
8.
»,
,
. .
. .
.-
.,
. .
. .
. .
.,
9.
10.
.–
, 1998, 210 .
. – ., «
», 2003.
, 2002, 534 .
.,
, 1993, 383 .
,
.–
.–
, 1994, 432 .
. ., . .
.
, . 223, 2, 471-474, 1975.
. .,
. .
.,
, 1989
.
, 1998.
.–
. -
.
. 4-
11.
(
12.
13.
/
14.
), .,
. .
. .
. .
. .
, 1999.
.
.–
.–
. ,
, 2003 ,
,
»,
.
. .
. .«
. .
. (
., 1999, 288 .
., 2001, 258 .
«
16.
. .
.
,
15.
.
. –
», 3«
,
. 161-169.
. 15,
, 2003 .
:
. .,
, 2004a, . 482-513.
02.02.2004b, 30 .,
182- 2004
», 4, 2004 .).
26
17.
. .
. 2004 (
18.
19.
«
. .
.
.–
.–
07.06.2004c, 30 .,
964», 8, 2004 ).
., ITI, 2003, 261 c.
«
»,
,
,
2003, . 68-75.
20.
. .
«
» – ., 1997, 605 .
21. Cook T.A. The curves of life. - L.: Constable and Co, 1914, 490 p.
22. He M., Petoukhov S., Ricci P. Genetic Code, Hamming Distance and Stochastic
Matrices. – Bulletin for Mathematical biology, 2004 (
)
23. Jacob F. Le modele linguistique en biologie. - Critique, Mars 1974, tome XXX, 322,
p.197-205
24. Petoukhov S.V. Genetic Code and the Ancient Chinese “Book of Changes”. - Symmetry:
Culture & Science, vol. 10, 3-4, 1999, .211-226.
25. Petoukhov S.V. Genetic Codes I: Binary sub-alphabets, bi-symmetric matrices and
golden section.- Symmetry in Genetic Information, ed. Petoukhov S.V., special issue of
the journal “Symmetry: Culture and Science”, Budapest, 2001a: Internat. Symmetry
Foundation, . 255-274
26. Petoukhov S.V. Genetic Codes II: Numeric Rules of Degeneracy and a Chronocyclic
Theory. - Symmetry in Genetic Information, ed. Petoukhov S.V., ISBN 963216 242 0,
special double issue of the journal “Symmetry: Culture and Science”, Budapest, 2001b:
International Symmetry Foundation, . 275-306.
27. Petoukhov S.V. The Biperiodic Table and Attributive Conception of Genetic Code. A
Problem of Unification Bases of Biological Languages. – In: Proceedings of “The 2003
International Conference on Mathematics and Engineering Techniques in Medicine and
Biological Sciences”, session “Bioinformatics 2003”, Las Vegas, June 23-26, 2003.
28. Petoukhov S.V. Attributive conception of genetic code, its bi-periodic tables and a
problem of unification bases of biological languages.-“Symmetry: Culture and Science”,
2003, # 1-4, p.40-59
29. Stent G.S. The Coming of the Golden Age. - N-Y, The Natural History Press, 1969.
30. Wittmann H.G. Ansatze zur Entschlusselung des genetishen Codes. – Die
Naturwissenschaften, 1961, B.48, 24, S. 55
Похожие документы
Скачать