В биохимии и молекулярной биологии фо л ин ом лк (укладкой

реклама
В биохимии и молекулярной биологии фол ин ом
лк (укладкой белка, от
англ. folding) называют процесс спонтанного сворачивания полипептидной цепи в
уникальную нативную пространственную структуру (так называемая третичная
структура).
П р хо п рвичной структуры полип пти
(сл в ) в тр тичную структуру (спр в ).
Каждая молекула белка начинает формироваться как полипептид, транслируемый из
последовательности мРНК в виде линейной цепочки аминокислот. У полипептида нет
устойчивой трѐхмерной структуры (пример в левой части изображения). Однако все
аминокислоты в цепочке имеют определѐнные химические свойства: гидрофобность,
гидрофильность, электрический заряд. При взаимодействии аминокислот друг с другом и
клеточным окружением получается хорошо определѐнная трѐхмерная структура —
конформация. В результате на внешней поверхности белковой глобулы формируются
полости активных центров, а также места контактов субъединиц мультимерных белков
друг с другом и с биологическими мембранами.
В редких случаях нативными могут быть сразу две конформации белка (т. н.
конформеры). Они могут сильно различаться, и даже выполнять различные функции. Для
этого необходимо, чтобы в разных областях фазового пространства белковой молекулы
существовали два примерно равных по энергии состояния, каждое из которых будет
встречаться в нативной форме с соответствующей вероятностью.
Для стабилизации третичной структуры многие белки в клетке подвергаются
посттрансляционной модификации. Весьма часто встречаются дисульфидные мостики
между пространственно близкими участками полипептидной цепи.
Для корректной работы белков весьма важна правильная трѐхмерная структура. Ошибки
сворачивания обычно приводят к образованию неактивного белка с отличающимися
свойствами (более подробно это описано в статье Прионы). Считается, что некоторые
болезни происходят от накопления в клетках неправильно свѐрнутых белков.[1]
В фолдинге участвуют белки-шапероны. И хотя большинство только что
синтезированных белков могут сворачиваться и при отсутствии шаперонов, некоторому
меньшинству обязательно требуется их присутствие.
Механизм сворачивания белков до конца не изучен. Экспериментальное определение
трѐхмерной структуры белка часто очень сложно и дорого. Однако аминокислотная
последовательность белка обычно известна. Поэтому учѐные пытаются использовать
различные биофизические методы, чтобы предсказать полную структуру белка из его
последовательности.[2]
лки (прот ины, полип пти ы[1]) — высокомолекулярные органические вещества,
состоящие из соединѐнных в цепочку пептидной связью альфа-аминокислот. В живых
организмах аминокислотный состав белков определяется генетическим кодом, при
синтезе в большинстве случаев используется 20 стандартных аминокислот. Множество их
комбинаций дают большое разнообразие свойств молекул белков. Кроме того,
аминокислоты в составе белка часто подвергаются посттрансляционным модификациям,
которые могут возникать и до того, как белок начинает выполнять свою функцию, и во
время его «работы» в клетке. Часто в живых организмах несколько молекул белков
образуют сложные комплексы, например, фотосинтетический комплекс.
Крист ллы р зличных лков, выр щ нны н космич ской ст нции «Мир» и во
вр мя полѐтов ш ттлов НАСА. Высокоочищ нны
лки при низкой т мп р тур
о р зуют крист ллы, которы используют ля получ ния мо ли нно о лк .
Функции белков в клетках живых организмов более разнообразны, чем функции других
биополимеров — полисахаридов и ДНК. Так, белки-ферменты катализируют протекание
биохимических реакций и играют важную роль в обмене веществ. Некоторые белки
выполняют структурную или механическую функцию, образуя цитоскелет,
поддерживающий форму клеток. Также белки играют важную роль в сигнальных
системах клеток, при иммунном ответе и в клеточном цикле.
Белки — важная часть питания животных и человека, поскольку в их организме не могут
синтезироваться все необходимые аминокислоты и часть из них поступает с белковой
пищей. В процессе пищеварения ферменты разрушают потреблѐнные белки до
аминокислот, которые используются при биосинтезе белков организма или подвергаются
дальнейшему распаду для получения энергии.
Определение аминокислотной последовательности первого белка — инсулина — методом
секвенирования белков принесло Фредерику Сенгеру Нобелевскую премию по химии в
1958 году. Первые трѐхмерные структуры белков гемоглобина и миоглобина были
получены методом дифракции рентгеновских лучей, соответственно, Максом Перуцем и
Джоном Кендрю в 1958 году[2][3], за что в 1962 году они получили Нобелевскую премию
по химии.
История изуч ния
Антуан Франсуа де Фуркруа, основоположник изуч ния
лков
Белки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в
результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учѐных, в которых
было отмечено свойство белков коагулировать (денатурировать) под воздействием
нагревания или кислот. В то время были исследованы такие белки, как альбумин
(«яичный белок»), фибрин (белок из крови) и глютен из зерна пшеницы. Голландский
химик Геррит Мульдер провѐл анализ состава белков и выдвинул гипотезу, что
практически все белки имеют сходную эмпирическую формулу. Термин «протеин» для
обозначения подобных молекул был предложен в 1838 году шведским химиком Якобом
Берцелиусом[4]. Мульдер также определил продукты разрушения белков — аминокислоты
и для одной из них (лейцина) с малой долей погрешности определил молекулярную
массу — 131 дальтон. В 1836 Мульдер предложил первую модель химического строения
белков. Основываясь на теории радикалов он сформулировал понятие о минимальной
структурной единице состава белка, C16H24N4O5, которая была названа «протеин», а
теория — «теорией протеина»[5]. По мере накопления новых данных о белках теория стала
неоднократно подвергаться критике, но до конца 1850-х несмотря на критику ещѐ
считалась общепризнанной.
К концу XIX века было исследовано большинство аминокислот, которые входят в состав
белков. В 1894 году немецкий физиолог Альбрехт Коссель выдвинул теорию, согласно
которой именно аминокислоты являются основными структурными элементами белков [6].
В начале XX века немецкий химик Эмиль Фишер экспериментально доказал, что белки
состоят из аминокислотных остатков, соединѐнных пептидными связями. Он же
осуществил первый анализ аминокислотной последовательности белка и объяснил
явление протеолиза
Однако центральная роль белков в организмах не была признана до 1926 года, когда
американский химик Джеймс Самнер (впоследствии — лауреат Нобелевской премии)
показал, что фермент уреаза является белком[7].
Сложность выделения чистых белков затрудняла их изучение. Поэтому первые
исследования проводились с использованием тех полипептидов, которые могли быть
очищены в большом количестве, то есть белков крови, куриных яиц, различных токсинов,
а также пищеварительных/метаболических ферментов, выделяемых после забоя скота. В
конце 1950-х годов компания Armour Hot Dog Co. смогла очистить килограмм бычьей
панкреатической рибонуклеазы А, которая стала экспериментальным объектом для
многих учѐных.
Идея о том, что вторичная структура белков — результат образования водородных связей
между аминокислотами, была высказана Уильямом Астбери в 1933 году, но Лайнус
Полинг считается первым учѐным, который смог успешно предсказать вторичную
структуру белков. Позднее Уолтер Каузман, опираясь на работы Кая Линдерстрѐм-Ланга,
внѐс весомый вклад в понимание законов образования третичной структуры белков и роли
в этом процессе гидрофобных взаимодействий. В 1949 году Фред Сенгер определил
аминокислотную последовательность инсулина, продемонстрировав таким способом, что
белки — это линейные полимеры аминокислот, а не их разветвлѐнные (как у некоторых
сахаров) цепи, коллоиды или циклолы. Первые структуры белков, основанные на
дифракции рентгеновских лучей на уровне отдельных атомов были получены в 1960-х
годах и с помощью ЯМР в 1980-х годах. В 2006 году Банк данных о белках (Protein Data
Bank) содержал около 40 000 структур белков.
В XXI веке исследование белков перешло на качественно новый уровень, когда
исследуются не только индивидуальные очищенные белки, но и одновременное
изменение количества и посттрансляционных модификаций большого числа белков
отдельных клеток, тканей или организмов. Эта область биохимии называется
протеомикой. С помощью методов биоинформатики стало возможно не только обработать
данные рентгенно-структурного анализа, но и предсказать структуру белка, основываясь
на его аминокислотной последовательности. В настоящее время криоэлектронная
микроскопия больших белковых комплексов и предсказание малых белков и доменов
больших белков с помощью компьютерных программ по точности приближаются к
разрешению структур на атомном уровне.
Свойств
Ср внит льный р зм р лков. Сл в н пр во: нтит ло (IgG), мо ло ин, инсулин
( ормон),
нил ткин з (ф рм нт) и лют минсинт т з (ф рм нт)
Размер белка может измеряться в дальтонах (молекулярная масса), чаще из-за
относительно большой величины молекулы в производных единицах — килодальтонах
(кДа). Белки дрожжей, в среднем, состоят из 466 аминокислот и имеют молекулярную
массу 53 кДа. Самый большой из известных в настоящее время белков — титин —
является компонентом саркомеров мускулов; молекулярная масса его различных изоформ
варьирует в интервале от 3000 до 3700 кДа, он состоит из 38 138 аминокислот (в
человеческой мышце solius[8]).
Белки являются амфотерными полиэлектролитами (полиамфолитами), при этом группами,
способными к ионизации в растворе, являются карбоксильные остатки боковых цепей
кислых аминокислот (аспарагиновая и глутаминовая кислоты) и азотсодержащие группы
боковых цепей основных аминокислот (в первую очередь ω-аминогруппа лизина и
амидиновый остаток CNH(NH2) аргинина, в несколько меньшей степени — имидазольный
остаток гистидина). Белки как полиамфолиты характеризуются изоэлектрической точкой
(pI) — кислотностью среды pH, при которой молекулы данного белка не несут
электрического заряда и, соответственно, не перемещаются в электрическом поле
(например, при электрофорезе). Величина pI определяется отношением кислотных и
основных аминокислотных остатков в белке: увеличение количества остатков основных
аминокислот в данном белке ведѐт к увеличению pI; увеличение количества остатков
кислых аминокислот приводит к снижению значения pI.
Значение изоэлектрической точки является характерной константой белков. Белки с pI
меньше 7 называются кислотными, а белки с pI больше 7 — основными. В целом, pI белка
зависит от выполняемой им функции: изоэлектрическая точка большинства белков тканей
позвоночных лежит в пределах от 5,5 до 7,0, однако в некоторых случаях значения лежат
в экстремальных областях: так, например, для пепсина — протеолитического фермента
сильнокислого желудочного сока pI ~ 1[9], а для сальмина — белка-протамина молок
лосося, особенностью которого является чрезвычайно высокое содержание аргинина, pI ~
12. Белки, связывающиеся с нуклеиновыми кислотами за счѐт электростатического
взаимодействия с фосфатными остатками нуклеиновых кислот, часто являются
основными белками. Примером таких белков служат гистоны и протамины.
Белки отличаются по степени растворимости в воде, но большинство белков в ней
растворяются. К нерастворимым относятся, например, кератин (белок, из которого
состоят волосы, шерсть млекопитающих, перья птиц и т. п.) и фиброин, который входит в
состав шѐлка и паутины. Белки также делятся на гидрофильные и гидрофобные. К
гидрофильным относятся большинство белков цитоплазмы, ядра и межклеточного
вещества, в том числе нерастворимые кератин и фиброин. К гидрофобным относятся
большинство белков, входящих в состав биологических мембран интегральных
мембранных белков, которые взаимодействуют с гидрофобными липидами мембраны[10]
(у этих белков обычно есть и небольшие гидрофильные участки).
Д н тур ция
Н о р тим я
т мп р туры
н тур ция
лк
курино о яйц
по
воз йстви м высокой
Как правило, белки сохраняют структуру и, следовательно, физико-химические свойства,
например, растворимость в условиях, таких как температура и pH, к которым
приспособлен данный организм[7]. Резкое изменение этих условий, например, нагревание
или обработка белка кислотой или щѐлочью приводит к потере четвертичной, третичной и
вторичной структур белка, называемой денатурацией. Самый известный случай
денатурации белка в быту — это приготовление куриного яйца, когда под воздействием
высокой температуры растворимый в воде прозрачный белок овальбумин становится
плотным, нерастворимым и непрозрачным. Денатурация в некоторых случаях обратима,
как в случае осаждения (преципитации) водорастворимых белков с помощью солей
аммония, и используется как способ их очистки[11].
Просты и сложны
лки
В состав многих белков помимо пептидных цепей входят и неаминокислотные
фрагменты, по этому критерию белки делят на две большие группы — простые и сложные
белки (протеиды). Простые белки содержат только аминокислотные цепи, сложные белки
содержат также неаминокислотные фрагменты. Эти фрагменты небелковой природы в
составе сложных белков называются «простетическими группами». В зависимости от
химической природы простетических групп среди сложных белков выделяют следующие
классы:






Гликопротеиды, содержащие в качестве простетической группы ковалентно
связанные углеводные остатки и их подкласс — протеогликаны, с
мукополисахаридными простетическими группами. В образованию связи с
углеводными остатками обычно участвуют гидроксильные группы серина или
треонина. Большая часть внеклеточных белков, в частности, иммуноглобулины —
гликопротеиды. В протеогликанах углеводная часть составляет ~95 %, они
являются основным компонентом межклеточного матрикса.
Липопротеиды, содержащие в качестве простетической части нековалентно
связанные липиды. Липопротеиды, образованные белками-аполипопротеинами
связывающимися с ними липидами и выполняют функцию транспорта липидов.
Металлопротеиды, содержащие негемовые координационно связанные ионы
металлов. Среди металлопротеидов есть белки, выполняющие депонирующие и
транспортные функции (например, железосодержащие ферритин и трансферрин) и
ферменты
(например,
цинксодержащая
карбоангидраза
и
различные
супероксиддисмутазы, содержащие в качестве активных центров ионы меди,
марганца, железа и других металлов)
Нуклеопротеиды, содержащие нековалентно связанные ДНК или РНК, в частности,
хроматин, из которого состоят хромосомы, является нуклеопротеидом.
Фосфопротеиды, содержащие в качестве простетической группы ковалентно
связанные остатки фосфорной кислоты. В образованию сложноэфирной связи с
фосфатом участвуют гидроксильные группы серина или треонина,
фосфопротеинами являются, в частности, казеин молока.
Хромопротеиды — собирательное название сложных белков с окрашенными
простетическими группами различной химической природы. К ним относятся
множество белков с металлсодержащей порфириновой простетической группой,
выполняющие разнообразные функции — гемопротеины (белки содержащие в
качестве простетической группы гем — гемоглобин, цитохромы и др.),
хлорофиллы; флавопротеиды с флавиновой группой, и др.
Структур
лк
Сх м тич ско изо р ж ни о р зов ния п пти ной связи (спр в ). По о н я
р кция происхо ит в мол кулярной м шин по о р зов нию лк — ри осом
Ср вн ни
минокислотных посл ов т льност й
лков (в
нном случ —
мо ло инов) из р зных ор низмов позволя т опр лять уч стки, в жны ля
функциониров ния лков, т кж эволюционную историю ср внив мых ви ов
Молекулы белков представляют собой линейные полимеры, состоящие из α-Lаминокислот (которые являются мономерами) и, в некоторых случаях, из
модифицированных основных аминокислот (правда, модификации происходят уже после
синтеза белка на рибосоме). Для обозначения аминокислот в научной литературе
используются одно- или трѐхбуквенные сокращения. Хотя на первый взгляд может
показаться, что использование в большинстве белков «всего» 20 видов аминокислот
ограничивает разнообразие белковых структур, на самом деле количество вариантов
трудно переоценить: для цепочки всего из 5 аминокислот оно составляет уже более 3
миллионов, а цепочка из 100 аминокислот (небольшой белок) может быть представлена
более чем в 10130 вариантах. Белки длиной от 2 до нескольких десятков аминокислотных
остатков часто называют п пти ми, при большей степени полимеризации — лк ми,
хотя это деление весьма условно.
При образовании белка в результате взаимодействия α-аминогруппы (-NH2) одной
аминокислоты с α-карбоксильной группой (-COOH) другой аминокислоты образуются
пептидные связи. Концы белка называют C- и N-концом (в зависимости от того, какая из
групп концевой аминокислоты свободна: -COOH или -NH2, соответственно). При синтезе
белка на рибосоме новые аминокислоты присоединяются к C-концу, поэтому название
пептида или белка даѐтся путѐм перечисления аминокислотных остатков начиная с Nконца.
Последовательность аминокислот в белке соответствует информации, содержащейся в
гене данного белка. Эта информация представлена в виде последовательности
нуклеотидов, причѐм одной аминокислоте соответствует в ДНК последовательность из
трѐх нуклеотидов — так называемый трипл т или кодон. То, какая аминокислота
соответствует данному кодону в мРНК, определяется генетическим кодом, который может
несколько отличаться у разных организмов. Синтез белков на рибосомах происходит, как
правило, из 20 аминокислот, называемых стандартными [12]. Триплетов, которыми
закодированы аминокислоты в ДНК, у разных организмов от 61 до 63 (то есть от числа
возможных триплетов (4³ = 64), вычтено число стоп-кодонов (1—3)). Поэтому появляется
возможность, что большинство аминокислот может быть закодировано разными
триплетами. То есть, генетический код может является избыточным или, иначе,
вырожденным. Это было окончательно доказано в эксперименте при анализе мутаций [13].
Генетический код, кодирующий различные аминокислоты имеет разную степень
вырожденности (кодируются от 1 до 6 кодонами), это зависит от частоты встречаемости
данной аминокислоты в белках, за исключением аргинина[13]. Часто основание в третьем
положении оказывается несущественным для специфичности, то есть одна аминокислота
может быть представлена четырьмя кодонами, различающимися только третьим
основанием. Иногда различие состоит в предпочтении пурина пиримидину. Это называют
вырожденностью третьего основания.
Такой трѐхкодонный код сложился эволюционно рано. Но существование различий в
некоторых организмах, появившихся на разных эволюционных стадиях, указывает на то,
что он был не всегда таким.
Согласно некоторым моделям, сначала код существовал в примитивном виде, когда малое
число кодонов обозначало сравнительно небольшое число аминокислот. Более точное
значение кодонов и большее число аминокислот могли быть введены позже. Сначала
только первые два из трех оснований могли быть использованы для узнавания [что
зависит от структуры тРНК].
Гомологичные белки (предположительно имеющие общее эволюционное происхождение
и нередко выполняющие одну и ту же функцию), например, гемоглобины разных
организмов, имеют во многих местах цепи идентичные, консервативные остатки
аминокислот. В других местах находятся различные аминокислотные остатки,
называемые вариабельными. По степени гомологии (сходства аминокислотной
последовательности) возможна оценка эволюционного расстояния между таксонами, к
которым принадлежат сравниваемые организмы.
Уровни ор низ ции
Уровни структуры
ч тв ртичн я
лков: 1 — п рвичн я, 2 — вторичн я, 3 — тр тичн я, 4 —
П р окс Л винт ля — в 1968 году Сайрус Левинталь сформулировал известный
парадокс: «Промежуток времени, за который полипептид приходит к своему скрученному
состоянию, на много порядков меньше, чем если бы полипептид просто перебирал все
возможные конфигурации»[1][2]
Чтобы разрешить данный парадокс, необходимо ответить на вопрос: «Как белок выбирает
свою нативную структуру среди бесчисленного множества возможных?».
Число возможных конформаций ~10100 для цепи из 100 остатков, и их полный перебор
занял бы ~1080 лет, если один переход осуществлять за ~10−13 секунды.
Поэтому сложность проблемы заключается в том, что данный вопрос нельзя решить
экспериментально, так как придется ждать ~1080 лет.
Возможные причины этого парадокса следующие:[3]:
1. что теоретические модели, используемые для доказательства твердости не
соответствуют тому, что природа старается оптимизировать;
2. в ходе эволюции были отобраны только те белки, которые легко сворачиваются;
3. белки могут сворачиваться разными путями, не обязательно следуя глобально
оптимальному
Кроме последовательности аминокислот полипептида (первичной структуры), крайне
важна трѐхмерная структура белка, которая формируется в процессе фолдинга (от
англ. folding, «сворачивание»). Трѐхмерная структура формируется в результате
взаимодействия структур более низких уровней. Выделяют четыре уровня структуры
белка[14]:


П рвичн я структур — последовательность аминокислот в полипептидной цепи.
Важными особенностями первичной структуры являются консервативные
мотивы — сочетания аминокислот, играющих ключевую роль в функциях белка.
Консервативные мотивы сохраняются в процессе эволюции видов, по ним часто
удаѐтся предсказать функцию неизвестного белка.
Вторичн я структур — локальное упорядочивание фрагмента полипептидной
цепи, стабилизированное водородными связями. Ниже приведены самые
распространѐнные типы вторичной структуры белков:
o α-спирали — плотные витки вокруг длинной оси молекулы, один виток
составляют 3,6 аминокислотных остатка, и шаг спирали составляет 0,54
нм[15] (так что на один аминокислотный остаток приходится 0,15 нм),
спираль стабилизирована водородными связями между H и O пептидных
групп, отстоящих друг от друга на 4 звена. Спираль построена
исключительно из одного типа стереоизомеров аминокислот (L). Хотя она
может быть как левозакрученной, так и правозакрученной, в белках
преобладает правозакрученная. Спираль нарушают электростатические
взаимодействия глутаминовой кислоты, лизина, аргинина. Расположенные
близко друг к другу остатки аспарагина, серина, треонина и лейцина могут
стерически мешать образованию спирали, остатки пролина вызывает изгиб
цепи и также нарушает α-спирали.
o β-листы (складчатые слои) — несколько зигзагообразных полипептидных
цепей, в которых водородные связи образуются между относительно
o
o
o
удалѐнными друг от друга (0,347 нм на аминокислотный остаток [15]) в
первичной структуре аминокислотами или разными цепями белка, а не
близко расположенными, как имеет место в α-спирали. Эти цепи обычно
направлены N-концами в противоположные стороны (антипараллельная
ориентация). Для образования β-листов важны небольшие размеры боковых
групп аминокислот, преобладают обычно глицин и аланин.
π-спирали;
310-спирали;
неупорядоченные фрагменты.

Тр тичн я или трѐхм рн я структур — пространственное строение
полипептидной цепи (набор пространственных координат составляющих белок
атомов).
Структурно
состоит
из
элементов
вторичной
структуры,
стабилизированных различными типами взаимодействий, в которых гидрофобные
взаимодействия играют важнейшую роль. В стабилизации третичной структуры
принимают участие:
o ковалентные связи (между двумя остатками цистеина — дисульфидные
мостики);
o ионные связи между противоположно заряженными боковыми группами
аминокислотных остатков;
o водородные связи;
o гидрофильно-гидрофобные
взаимодействия. При взаимодействии с
окружающими молекулами воды белковая молекула «стремится»
свернуться так, чтобы неполярные боковые группы аминокислот оказались
изолированы от водного раствора; на поверхности молекулы оказываются
полярные гидрофильные боковые группы.

Четверичная структура (или субъединичная, доменная) — взаимное расположение
нескольких полипептидных цепей в составе единого белкового комплекса.
Белковые молекулы, входящие в состав белка с четвертичной структурой,
образуются на рибосомах по отдельности и лишь после окончания синтеза
образуют общую надмолекулярную структуру. В состав белка с четвертичной
структурой могут входить как идентичные, так и различающиеся полипептидные
цепочки. В стабилизации четвертичной структуры принимают участие те же типы
взаимодействий, что и в стабилизации третичной. Надмолекулярные белковые
комплексы могут состоять из десятков молекул.
Окруж ни
лков
Р зны спосо ы изо р ж ния трѐхм рной структуры лк н прим р ф рм нт
триозофосф тизом р зы. Сл в — «п лочков я» мо ль, с изо р ж ни м вс х
томов и связ й м ж у ними; цв т ми пок з ны эл м нты. В с р ин изо р ж ны
структурны мотивы, α-спир ли и β-листы. Спр в изо р ж н конт ктн я
пов рхность
лк , постро нн я с учѐтом в н- р-в льсовых р иусов томов;
цв т ми пок з ны осо нности ктивности уч стков
По общему типу строения белки можно разбить на три группы:
1. Фибриллярные белки — образуют полимеры, их структура обычно
высокорегулярна и поддерживается, в основном, взаимодействиями между
разными цепями. Они образуют микрофиламенты, микротрубочки, фибриллы,
поддерживают структуру клеток и тканей. К фибриллярным белкам относятся
кератин и коллаген.
2. Глобулярные белки — водорастворимы, общая форма молекулы более или менее
сферическая. Среди глобулярных и фибриллярных белков выделяют подгруппы.
Например,
изображѐнный
на
картинке
справа
глобулярный
белок,
триозофосфатизомераза, состоит из восьми α-спиралей, расположенных на
внешней поверхности структуры и восьми параллельных β-слоѐв внутри
структуры. Белки с подобным трѐхмерным строением называются αβ-баррелы (от
англ. barrel — бочка)[16].
3. Мембранные белки — имеют пересекающие клеточную мембрану домены, но
части их выступают из мембраны в межклеточное окружение и цитоплазму клетки.
Мембранные белки выполняют функцию рецепторов, то есть осуществляют
передачу сигналов, а также обеспечивают трансмембранный транспорт различных
веществ. Белки-транспортеры специфичны, каждый из них пропускает через
мембрану только определѐнные молекулы или определѐнный тип сигнала.
О р зов ни и по
рж ни структуры
лков в живых ор низм х
Изо р ж ни мо ли компл кс
кт ри льных ш п ронов GroES и GroEL (ви
св рху). Ч сть р иров нно о лк поступ т в ц нтр льную полость компл кс ,
в р зульт т и ролиз АТФ происхо ит изм н ни
о структуры
Способность белков восстанавливать правильную трѐхмерную структуру после
денатурации позволила выдвинуть гипотезу о том, что вся информация о конечной
структуре белка содержится в его аминокислотной последовательности. В настоящее
время общепризнана теория о том, что в результате эволюции стабильная конформация
белка обладает минимальной свободной энергией по сравнению с другими возможными
конформациями этого полипептида[17].
Тем не менее, в клетках существует группа белков, функция которых — обеспечение
восстановления структуры белков после повреждения, а также создание и диссоциация
белковых комплексов. Эти белки называются шаперонами. Концентрация многих
шаперонов в клетке возрастает при резком повышении температуры окружающей среды,
поэтому они относятся к группе Hsp (англ. heat shock proteins — белки теплового
шока)[18]. Важность нормальной работы шаперонов для функционирования организма
может быть проиллюстрирована на примере шаперона α-кристаллина, входящего в состав
хрусталика глаза человека. Мутации в этом белке приводят к помутнению хрусталика изза агрегирования белков и, как результат, к катаракте[19].
Синт з
лков
Химич ский синт з
Короткие белки могут быть синтезированы химическим путѐм с помощью группы
методов, которые используют органический синтез — например, химическое
лигирование[20]. Большинство методов химического синтеза проходят в направлении от Cконца к N-концу, в противоположность биосинтезу. Таким образом можно синтезировать
короткий иммунногенный пептид (эпитоп), служащий для получения антител путѐм
инъекции в животных, или получения гибридом; химический синтез также используется
для получения ингибиторов некоторых ферментов[21]. Химический синтез позволяет
вводить искусственные, то есть не встречающиеся в обычных белках аминокислоты —
например, присоединять флюоресцентные метки к боковым цепям аминокислот. Однако
химические методы синтеза неэффективны при длине белков более 300 аминокислот;
кроме того, искусственные белки могут иметь неправильную третичную структуру, и у
аминокислот искусственных белков отсутствуют посттрансляционные модификации.
иосинт з
лков
Унив рс льный спосо : ри осомный синт з
Мол кулярн я мо ль м лой (сл в ) и ольшой (спр в ) су ъ иниц кт ри льной
ри осомы — мол кулярной м шины, синт зирующ й
лки. Голу ым цв том
пок з ны лки в сост в ри осомы, но основную структурную роль выполня т
рРНК
Белки синтезируются живыми организмами из аминокислот на основе информации,
закодированной в генах. Каждый белок состоит из уникальной последовательности
аминокислот, которая определяется нуклеотидной последовательностью гена,
кодирующего данный белок. Генетический код составляется из трѐхбуквенных «слов»,
называемых кодонами; каждый кодон отвечает за присоединение к белку одной
аминокислоты: например, сочетание АУГ соответствует метионину. Поскольку ДНК
состоит из четырѐх типов нуклеотидов, то общее число возможных кодонов равно 64; а
так как в белках используется 20 аминокислот, то многие аминокислоты определяются
более, чем одним кодоном. Гены, кодирующие белки сначала транскрибируются в
последовательность нуклеотидов матричной РНК (мРНК) белками РНК-полимеразами.
У прокариот мРНК может считываться рибосомами в аминокислотную
последовательность белков сразу после транскрипции, а у эукариот она транспортируется
из ядра в цитоплазму, где находятся рибосомы. Скорость синтеза белков выше у
прокариот и может достигать 20 аминокислот в секунду[22].
Процесс синтеза белка на основе молекулы мРНК называется трансляцией. Во время
начальной стадии биосинтеза белков, инициации, обычно метиониновый кодон узнаѐтся
малой субъединицей рибосомы, к которой при помощи белковых факторов инициации
присоединена метиониновая транспортная РНК (тРНК). После узнавания стартового
кодона к малой субъединице присоединяется большая субъединица и начинается вторая
стадия трансляции — элонгация. При каждом движении рибосомы от 5' к 3' концу мРНК
считывается один кодон путѐм образования водородных связей между тремя
нуклеотидами (кодоном) мРНК и комплементарным ему антикодоном транспортной РНК,
к которой присоединена соответствующая аминокислота. Синтез пептидной связи
катализируется рибосомальной РНК (рРНК), образующей пептидилтрансферазный центр
рибосомы. Рибосомальная РНК катализирует образование пептидной связи между
последней аминокислотой растущего пептида и аминокислотой, присоединѐнной к тРНК,
позиционируя атомы азота и углерода в положении, благоприятном для прохождения
реакции. Ферменты аминоацил-тРНК-синтетазы присоединяют аминокислоты к их тРНК.
Третья, и последняя стадия трансляции, терминация, происходит при достижении
рибосомой стоп-кодона, после чего белковые факторы терминации гидролизуют
последнюю тРНК от белка, прекращая его синтез. Таким образом, в рибосомах белки
всегда синтезируются от N- к C-концу.
Н ри осомный синт з
У низших грибов и некоторых бактерий существует менее распространѐнный способ
биосинтеза белков, который не требует участия рибосом. Синтез пептидов, обычно
вторичных метаболитов, проводится высокомолекулярным белковым комплексом, так
называемой НРС-синтазой. НРС-синтаза обычно состоит из нескольких доменов или
отдельных белков, осуществляющих селекцию аминокислот, образование пептидной
связи, высвобождение синтезированного пептида. Иногда содержит домен, способный
изомеризовать L-аминокислоты (нормальная форма) в D-форму.[23][24]
Внутрикл точный тр нспорт и сортировк
лков
Синтезируемые в цитоплазме на рибосомах белки должны попадать в разные
компартменты клетки — ядро, митохондрии, ЭПР, аппарат Гольджи, лизосомы и др., а
некоторые белки должны попасть во внеклеточную среду. Для попадания в определѐнный
компартмент белок должен обладать специфической меткой. В большинстве случаев
такой меткой является часть аминокислотной последовательности самого белка
(лидерный пептид, или сигнальная последовательность белка). В некоторых случаях
меткой служат посттрансляционно присоединѐнные к белку олигосахариды. Транспорт
белков в ЭПР осуществляется по мере их синтеза, так как рибосомы, синтезирующие
белки с сигнальной последовательностью для ЭПР, «садятся» на специальные
транслокационные комплексы на мембране ЭПР. Из ЭПР в аппарат Гольджи, а оттуда в
лизосомы, на внешнюю мембрану или во внеклеточную среду белки попадают путѐм
везикулярного транспорта. В ядро белки, обладающие сигнальной последовательностью
для ядра, попадают через ядерные поры. В митохондрии и хлоропласты белки,
обладающие соответствующими сигнальными последовательностями, попадают через
специфические белковые поры-транслокаторы при участии шаперонов.
Посттр нсляционн я мо ифик ция
лков
Мол кулы у иквитин (ор нж вы и розовы ) присо ин ны к
пр в щ я о
р
цию
лку Src ( олу ой),
После завершения трансляции и высвобождения белка из рибосомы аминокислоты в
составе полипептидной цепи подвергаются разнообразным химическим модификациям.
Примерами посттрансляционной модификации являются:






присоединение различных функциональных групп (ацетил-, метил- и фосфатных
групп);
присоединение липидов и углеводородов;
изменение стандартных аминокислот на нестандартные (образование цитруллина);
образование структурных изменений (образование дисульфидных мостиков между
цистеинами);
удаление части белка как в начале (сигнальная последовательность), так и в
отдельных случаях в середине (инсулин);
добавление небольших белков, которые влияют на деградацию белков
(сумоилирование и убиквитинирование).
При этом тип модификации может быть как универсальным (добавление цепей,
состоящих из мономеров убиквитина, служит сигналом для деградации этого белка
протеасомой), так и специфическим для данного белка[25]. В то же время один и тот же
белок может подвергаться многочисленным модификациям. Так, гистоны (белки,
входящие в состав хроматина у эукариот) в разных условиях могут подвергаться до 150
различных модификаций[26].
Функции
лков в ор низм
Так же как и другие биологические макромолекулы (полисахариды, липиды) и
нуклеиновые кислоты, белки — необходимые компоненты всех живых организмов, они
участвуют в большинстве жизненных процессов клетки. Белки осуществляют обмен
веществ и энергетические превращения. Белки входят в состав клеточных структур —
органелл, секретируются во внеклеточное пространство для обмена сигналами между
клетками, гидролиза пищи и образования межклеточного вещества.
Следует отметить, что классификация белков по их функции достаточно условна, потому
что у эукариот один и тот же белок может выполнять несколько функций. Хорошо
изученным примером такой многофункциональности служит лизил-тРНК-синтетаза —
фермент из класса аминоацил-тРНК синтетаз, который не только присоединяет лизин к
тРНК, но и регулирует транскрипцию нескольких генов[27]. Многие функции белки
выполняют благодаря своей ферментативной активности. Так, ферментами являются
двигательный белок миозин, регуляторные белки протеинкиназы, транспортный белок
натрий-калиевая аденозинтрифосфатаза и др.
Мол кулярн я мо ль ф рм нт ур зы
кт рии Helicobacter pylori
К т литич ск я функция
Наиболее хорошо известная роль белков в организме — катализ различных химических
реакций. Ферменты — группа белков, обладающая специфическими каталитическими
свойствами, то есть каждый фермент катализирует одну или несколько сходных реакций.
Ферменты катализируют реакции расщепления сложных молекул (катаболизм) и их
синтеза (анаболизм), а также репликации и репарации ДНК и матричного синтеза РНК.
Известно несколько тысяч ферментов; среди них такие, как, например, пепсин,
расщепляют белки в процессе пищеварения. В процесс посттрансляционной модификации
некоторые ферменты добавляют или удаляют химические группы на других белках.
Известно около 4000 реакций, катализируемых белками [28]. Ускорение реакции в
результате ферментативного катализа иногда огромно: например, реакция,
катализируемая ферментом оротат-карбоксилазой, протекает в 1017 быстрее
некатализируемой (78 миллионов лет без фермента, 18 миллисекунд с участием
фермента)[29]. Молекулы, которые присоединяются к ферменту и изменяются в результате
реакции, называются субстратами.
Хотя ферменты обычно состоят из сотен аминокислот, только небольшая часть из них
взаимодействует с субстратом, и ещѐ меньшее количество — в среднем 3—4
аминокислоты, часто расположенные далеко друг от друга в первичной аминокислотной
последовательности — напрямую участвуют в катализе[30]. Часть фермента, которая
присоединяет субстрат и содержит каталитические аминокислоты, называется активным
центром фермента.
Структурн я функция
Структурные белки цитоскелета, как своего рода арматура, придают форму клеткам и
многим органоидам и участвуют в изменении формы клеток. Большинство структурных
белков являются филаментозными белками: например, мономеры актина и тубулина —
это глобулярные, растворимые белки, но после полимеризации они формируют длинные
нити, из которых состоит цитоскелет, позволяющий клетке поддерживать форму[31].
Коллаген и эластин — основные компоненты межклеточного вещества соединительной
ткани (например, хряща), а из другого структурного белка кератина состоят волосы,
ногти, перья птиц и некоторые раковины.
Мышино
(вв рху)
нтит ло против хол ры, присо инѐнно к у л во оро ному
нти ну
З щитн я функция
Существуют несколько видов защитных функций белков:
1. Физическая защита. В ней принимает участие коллаген — белок, образующий
основу межклеточного вещества соединительных тканей (в том числе костей,
хряща, сухожилий и глубоких слоев кожи)дермы); кератин, составляющий основу
роговых щитков, волос, перьев, рогов и др. производных эпидермиса. Обычно
такие белки рассматривают как белки со структурной функцией. Примерами этой
группы белков служат фибриногены и тромбины[32], участвующие в свѐртывании
крови.
2. Химическая защита. Связывание токсинов белковыми молекулами может
обеспечивать их детоксикацию. Особенно важную роль в детоксикации у человека
играют ферменты печени, расщепляющие яды или переводящие их в растворимую
форму, что способствует их быстрому выведению из организма[33].
3. Иммунная защита. Белки, входящие в состав крови и других биологических
жидкостей, участвуют в защитном ответе организма как на повреждение, так и на
атаку патогенов. Белки системы комплемента и антитела (иммуноглобулины)
относятся к белкам второй группы; они нейтрализуют бактерии, вирусы или
чужеродные белки. Антитела, входящие в состав адаптативной иммунной системы,
присоединяются к чужеродным для данного организма веществам, антигенам, и
тем самым нейтрализуют их, направляя к местам уничтожения. Антитела могут
секретироваться в межклеточное пространство или закрепляться в мембранах
специализированных В-лимфоцитов, которые называются плазмоцитами[34]. В то
время как ферменты имеют ограниченное сродство к субстрату, поскольку
слишком сильное присоединение к субстрату может мешать протеканию
катализируемой реакции, стойкость присоединения антител к антигену ничем не
ограничена[35].
Р уляторн я функция
Многие процессы внутри клеток регулируются белковыми молекулами, которые не
служат ни источником энергии, ни строительным материалом для клетки. Эти белки
регулируют транскрипцию, трансляцию, сплайсинг, а также активность других белков и
др. Регуляторную функцию белки осуществляют либо за счѐт ферментативной активности
(например, протеинкиназы), либо за счѐт специфического связывания с другими
молекулами, как правило, влияющего на взаимодействие с этими молекулами ферментов.
Так, транскрипция генов определяется присоединением факторов транскрипции —
белков-активаторов и белков-репрессоров к регуляторным последовательностям генов. На
уровне трансляции считывание многих мРНК также регулируется присоединением
белковых факторов[36], а деградация РНК и белков также проводится
специализированными белковыми комплексами[37]. Важнейшую роль в регуляции
внутриклеточных процессов играют протеинкиназы — ферменты, которые активируют
или подавляют активность других белков путѐм присоединения к ним фосфатных групп.
Структур мио ло ин с вы л нными α-спир лями
Си н льн я функция
Сигнальная функция белков — способность белков служить сигнальными веществами,
передавая сигналы между тканями, клетками или организмами. Часто сигнальную
функцию объединяют с регуляторной, так как многие внутриклеточные регуляторные
белки тоже осуществляют передачу сигналов.
Сигнальную функцию выполняют белки-гормоны, цитокины, факторы роста и др.
Гормоны переносятся кровью. Большинство гормонов животных — это белки или
пептиды. Связывание гормона с рецептором является сигналом, запускающим в клетке
ответную реакцию. Гормоны регулируют концентрации веществ в крови и клетках, рост,
размножение и другие процессы. Примером таких белков служит инсулин, который
регулирует концентрацию глюкозы в крови
Клетки взаимодействуют друг с другом с помощью сигнальных белков, передаваемых
через межклеточное вещество. К таким белкам относятся, например, цитокины и факторы
роста.
Цитокины — небольшие пептидные информационные молекулы. Они регулируют
взаимодействия между клетками, определяют их выживаемость, стимулируют или
подавляют рост, дифференцировку, функциональную активность и апоптоз, обеспечивают
согласованность действий иммунной, эндокринной и нервной систем. Примером
цитокинов может служить фактор некроза опухоли, который передаѐт сигналы
воспаления между клетками организма[38].
Тр нспортн я функция
Растворимые белки, участвующие в транспорте малых молекул, должны иметь высокое
сродство (аффинность) к субстрату, когда он присутствует в высокой концентрации, и
легко его высвобождать в местах низкой концентрации субстрата. Примером
транспортных белков можно назвать гемоглобин, который переносит кислород из лѐгких
к остальным тканям и углекислый газ от тканей к лѐгким, а также гомологичные ему
белки, найденные во всех царствах живых организмов[39].
Некоторые мембранные белки участвуют в транспорте малых молекул через мембрану
клетки, изменяя еѐ проницаемость. Липидный компонент мембраны водонепроницаем
(гидрофобен), что предотвращает диффузию полярных или заряженных (ионы) молекул.
Мембранные транспортные белки принято подразделять на белки-каналы и белкипереносчики. Белки-каналы содержат внутренние, заполненные водой поры, которые
позволяют ионам (через ионные каналы) или молекулам воды (через белки-аквапорины)
перемещаться через мембрану. Многие ионные каналы специализируются на транспорте
только одного иона; так, калиевые и натриевые каналы часто различают эти сходные ионы
и пропускают только один из них[40]. Белки-переносчики связывают, подобно ферментам,
каждую переносимую молекулу или ион и, в отличие от каналов, могут осуществлять
активный транспорт с использованием энергии АТФ. «Электростанция клетки» — АТФсинтаза, которая осуществляет синтез АТФ за счѐт протонного градиента, также может
быть отнесена к мембранным транспортным белкам[41].
З п сн я (р з рвн я) функция
лков
К таким белкам относятся так называемые резервные белки, которые запасаются в
качестве источника энергии и вещества в семенах растений и яйцеклетках животных;
белки третичных оболочек яйца (овальбумины) и основной белок молока (казеин) также
выполняют, главным образом, питательную функцию. Ряд других белков используется в
организме в качестве источника аминокислот, которые в свою очередь являются
предшественниками биологически активных веществ, регулирующих процессы
метаболизма.
Р ц пторн я функция
Белковые рецепторы могут как находиться в цитоплазме, так и встраиваться в клеточную
мембрану. Одна часть молекулы рецептора воспринимает сигнал, которым чаще всего
служит химическое вещество, а в некоторых случаях — свет, механическое воздействие
(например, растяжение) и другие стимулы. При воздействии сигнала на определѐнный
участок молекулы белок-рецептор происходят еѐ конформационные изменения. В
результате меняется конформация другой части молекулы, осуществляющей передачу
сигнала на другие клеточные компоненты. Существует несколько механизмов передачи
сигнала. Некоторые рецепторы катализируют определѐнную химическую реакцию; другие
служат ионными каналами, которые при действии сигнала открываются или закрываются;
третьи специфически связывают внутриклеточные молекулы-посредники. У мембранных
рецепторов часть молекулы, связывающаяся с сигнальной молекулой, находится на
поверхности клетки, а домен, передающий сигнал, внутри[42].
Движ ни мол кулы миозин при мыш чном сокр щ нии
Моторн я ( ви т льн я) функция
Целый класс моторных белков обеспечивает движения организма (например, сокращение
мышц, в том числе локомоцию (миозин), перемещение клеток внутри организма
(например, амебоидное движение лейкоцитов), движение ресничек и жгутиков, а также
активный и направленный внутриклеточный транспорт (кинезин, динеин). Динеины и
кинезины проводят транспортировку молекул вдоль микротрубочек с использованием
гидролиза АТФ в качестве источника энергии. Динеины переносят молекулы и органоиды
из периферических частей клетки по направлению к центросоме, кинезины в
противоположном направлении[43][44]. Динеины также отвечают за движение ресничек и
жгутиков эукариот. Цитоплазматические варианты миозина могут принимать участие в
транспорте молекул и органоидов по микрофиламентам.
лки в о м н в щ ств
Большинство микроорганизмов и растений могут синтезировать 20 стандартных
аминокислот, а также дополнительные ( нестандартные) аминокислоты, например,
цитруллин. Но если аминокислоты есть в окружающей среде, даже микроорганизмы
сохраняют энергию путѐм транспорта аминокислот внутрь клеток и выключения их
биосинтетических путей[45].
Аминокислоты, которые не могут быть синтезированы животными, называются
незаменимыми. Основные ферменты в биосинтетических путях, например,
аспартаткиназа, которая катализирует первый этап в образовании лизина, метионина и
треонина из аспартата, отсутствуют у животных.
Животные, в основном, получают аминокислоты из белков, содержащихся в пище. Белки
разрушаются в процессе пищеварения, который обычно начинается с денатурации белка
путѐм помещения его в кислотную среду и гидролиза с помощью ферментов, называемых
протеазами. Некоторые аминокислоты, полученные в результате пищеварения,
используются для синтеза белков организма, а остальные превращаются в глюкозу в
процессе глюконеогенеза или используются в цикле Кребса. Использование белка в
качестве источника энергии особенно важно в условиях голодания, когда собственные
белки организма, в особенности мускулов, служат источником энергии[46]. Аминокислоты
также являются важным источником азота в питании организма.
Единых норм потребления белков человека нет. Микрофлора толстого кишечника
синтезирует аминокислоты, которые не учитываются при составлении белковых норм.
М то ы колич ств нно о опр
л ния
лков
Для определения количества белка в образце используется ряд методик:




Биуретовый метод
Микробиуретовый метод
Метод Бредфорда
Метод Лоури
Прим ч ния
1. ↑ Muirhead H., Perutz M. Structure of hemoglobin. A three-dimensional Fourier synthesis of
reduced human hemoglobin at 5.5 A resolution // Nature : журнал. — 1963. — Т. 199. —
№ 4894. — С. 633—638.
2. ↑ Kendrew J., Bodo G., Dintzis H., Parrish R., Wyckoff H., Phillips D. A three-dimensional
model of the myoglobin molecule obtained by x-ray analysis // Nature : журнал. — 1958. —
Т. 181. — № 4610. — С. 662—666.
3. ↑ Leicester, Henry. «Berzelius, Jöns Jacob». Dictionary of Scientific Biography 2. New York:
Charles Scribner’s Sons. 90—97 (1980). ISBN 0-684-10114-9
4. ↑ Биоорганическая химия. — Просвещение, 1987.
5. ↑ Белки // Химическая энциклопедия. — Советская энциклопедия, 1988.
6. ↑ 1 2 N. H. Barton, D. E. G. Briggs, J. A. Eisen. «Evolution», Cold Spring Harbor Laboratory
Press, 2007 — P. 38. ISBN 978-0-87969-684-9
7. ↑ Fulton A, Isaacs W. (1991). «Titin, a huge, elastic sarcomeric protein with a probable role in
morphogenesis». Bioessays 13 (4): 157—161. PMID 1859393.
8. ↑ EC 3.4.23.1 — pepsin A
9. ↑ S J Singer. The Structure and Insertion of Integral Proteins in Membranes. Annual Review of
Cell Biology. Volume 6, Page 247—296. 1990
10. ↑ Страйер Л. Биохимия в 3 томах. — М.: Мир, 1984
11. ↑ Селеноцистеин — пример нестандартной аминокислоты.
12. ↑ 1 2 Б. Льюин. Гены. — М.: 1987. — 544 с.
13. ↑ Ленинджер А. Основы биохимии, в 3 томах. — М.: Мир, 1985.
14. ↑ 1 2 Лекция 2. Структурные уровни белков и нуклеиновых кислот («Основы биологии»,
Макеев Александр Владиславович, 1996 и 1997)
15. ↑ http://pdbdev.sdsc.edu:48346/pdb/molecules/pdb50_6.html
16. ↑ Anfinsen C. (1973). «Principles that Govern the Folding of Protein Chains». Science 181:
223—229. Нобелевская лекция. Автор, совместно с Стэнфордом Муром и Уильямом
Стейном, получил Нобелевскую премию по химии за «изучение рибонуклеазы, в
особенности взаимоотношений между аминокислотной последовательностью [фермента] и
[его] биологически активной конформацией».
17. ↑ Ellis RJ, van der Vies SM. (1991). «Molecular chaperones». Annu. Rev. Biochem. 60: 321—
347. DOI:10.1146/annurev.bi.60.070191.001541. PMID 1679318.
18. ↑ Sun Y, MacRae TH. (2005). «The small heat shock proteins and their role in human disease».
FEBS J. 60: 2613—2627. PMID 115943797.
19. ↑ Wilken J, Kent SB. Chemical protein synthesis. Curr Opin Biotechnol. 1998.9(4):412—426
20. ↑ Dawson PE, Kent SB. Synthesis of native proteins by chemical ligation. Annu Rev Biochem.
2000;69:923—960
21. ↑ Dobson CM. (2000). The nature and significance of protein folding. In Mechanisms of Protein
Folding 2nd ed. Ed. RH Pain. Frontiers in Molecular Biology series. Oxford University Press:
New York, NY.
22. ↑ Stack D, Neville C, Doyle S. Nonribosomal peptide synthesis in Aspergillus fumigatus and other
fungi. Microbiology. 2007 May; 153(Pt 5):1297—1306
23. ↑ Welker M, von Döhren H. Cyanobacterial peptides — nature’s own combinatorial biosynthesis.
FEMS Microbiol Rev. 2006 Jul; 30(4):530—563
24. ↑ Demartino GN, Gillette TG. Proteasomes: machines for all reasons. Cell. 2007 May 18.
129(4):659—662
25. ↑ Bronner C, Chataigneau T, Schini-Kerth VB, Landry Y. The «Epigenetic Code Replication
Machinery», ECREM: a promising drugable target of the epigenetic cell memory. Curr Med
Chem. 2007;14(25):2629—2641
26. ↑ Yannay-Cohen N, Razin E. (2000). «Translation and transcription: the dual functionality of
LysRS in mast cells». Mol Cells. 22: 127—132. PMID 17085962.
27. ↑ Bairoch A. (2000). «The ENZYME database in 2000». Nucleic Acids Res 28: 304—305. PMID
10592255.
28. ↑ Radzicka A, Wolfenden R. (1995). «A proficient enzyme». Science 6 (267): 90—93. PMID
7809611.
29. ↑ The Catalytic Site Atlas at The European Bioinformatics Institute
30. ↑ Erickson HP. Evolution of the cytoskeleton. Bioessays. 2007:668—677
31. ↑ Wolberg AS (2007). «Thrombin generation and fibrin clot structure». Blood Rev. 21(3): 131—
142. PMID 17208341.
32. ↑ Я. Кольман, К.-Г. Рем. Наглядная биохимия. М.: Мир, 2000, с. 308—309.
33. ↑ J. Li, D. R. Barreda, Y.-A. Zhang, H. Boshra, A. E. Gelman, S. LaPatra, L. Tort & J. O. Sunyer
(2006). «B lymphocytes from early vertebrates have potent phagocytic and microbicidal
abilities». Nature Immunology 7: 1116—1124. PMID 16980980.
34. ↑ Felix NJ, Allen PM. Specificity of T-cell alloreactivity. Rev Immunol. 2007 Dec; 7(12):942—
953
35. ↑ Hinnebusch AG. Translational regulation of GCN4 and the general amino acid control of yeast.
Annu Rev Microbiol. 2005;59:407—450
36. ↑ Anderson P, Kedersha N. RNA granules. Cell Biol. 2006:172(6):803—808
37. ↑ Повещенко А. Ф., Абрамов В. В., Козлов В. В. Цитокины — факторы нейроэндокринной
регуляции. Успехи физиологических наук. 2007 — 38(3):40—46
38. ↑ Wittenberg JB. On optima: the case of myoglobin-facilitated oxygen diffusion. Gene. 2007 Aug
15. 398(1—2):156—161.
39. ↑ Driessen AJ, Nouwen N. Protein Translocation Across the Bacterial Cytoplasmic Membrane.
Annu Rev Biochem. 2007 Dec 13 [Epub ahead of print]
40. ↑ Drory O, Nelson N. (2006). «The emerging structure of vacuolar ATPases». Physiology
(Bethesda). 21: 317—325. PMID 16990452.
41. ↑ Dupré DJ, Hébert TE. Biosynthesis and trafficking of seven transmembrane receptor signalling
complexes. Cell Signal. 2006;18(10):1549—1559
42. ↑ Karp G. Cell and Molecular Biology: Concepts and Experiments, Fourth ed, pp. 346—358.
John Wiley and Sons, Hoboken, NJ. 2005.
43. ↑ Schroer, Trina A. Dynactin. Annual Review of Cell and Developmental Biology. 2004 20,
759—779. PMID 15473859
44. ↑ Voet D, Voet JG. Biochemistry Vol 1 3rd ed., Hoboken, NJ (2004).
45. ↑ Brosnan J. (2003). «Interorgan amino acid transport and its regulation». J Nutr 133 (6 Suppl 1):
2068S-72S. PMID 12771367.
Лит р тур



Альбертс Б., Брей Д., Льюис Дж. и др. Молекулярная биология клетки. В 3 томах.
— М.: Мир, 1994. — ISBN 5-03-001986-3
Ленинджер А. Основы биохимии. В 3 томах. — М.: Мир, 1985.
Страйер Л. Биохимия. В 3 томах. — М.: Мир, 1984.
Скачать