ЧАСТОТЫ ГЕНОВ HLA-MICB В ПОПУЛЯЦИИ ТАТАР В

Вестник Челябинского государственного университета. 2013. № 7 (298).
Биология. Вып. 2. С. 34–35.
М. Н. Вавилов, А. Л. Бурмистрова, Г. В. Целищев, Т. А. Суслова
ЧАСТОТЫ ГЕНОВ HLA-MICB В ПОПУЛЯЦИИ ТАТАР
В СРАВНЕНИИ С ДРУГИМИ ПОПУЛЯЦИЯМИ
Производится сравнение частот распределения генов MICB в популяции татар, проживающей
на территории Челябинской области, с другими наиболее численными популяциями Южного Урала,
с популяцией русских и башкир.
Ключевые слова: популяционная иммуногенетика, MHC, HLA, MIC, татары, башкиры, русские.
Введение. MIC — группа неклассических генов HLA, расположенных на коротком плече 6-й
хромосомы в области HLA-I [1]. Из 7 известных
локусов генов MIC лишь MICB и соседний с ним
локус MICA кодируют полипептиды, которые являются лигандами для рецептора NKG2D на естественных киллерах (ЕК) и Т-лимфоцитах, тем самым участвуя в активации реакции клеточной
цитотоксичности, что имеет значение во врождённом и адаптивном иммунном ответе [2]. Локус
MICB, как и классические локусы HLA, высокополиморфны. Обнаружено около 30 вариантов аллелей MICB.
Распределение аллелей MICB в различных этносах мира имеет свои особенности. Сравнивая
частоты аллелей MICB, условно можно выделить монголоидные и европеоидные черты, характерные также и для основных этнических
групп Южного Урала. В предыдущих исследованиях были установлены статистически достоверные отличия в распределении аллелей MICB
в популяциях русских и башкир Челябинской
области. У русских по сравнению с башкирами достоверно выше частота MICB*004 и
MICB*005:03, что характерно для европеоидных популяций, у башкир достоверно выше
MICB*009N и MICB*014, что сближает их с монголоидными популяциями [3].
В данном исследовании было рассмотрено
распределение частот MICB в популяции татар.
Современные татары — это тюркоязычный народ, является вторым по численности народом
в Российской Федерации после русских. По итогам переписи населения 2002 г., в Челябинской
области проживает более 200 тыс. человек татарской национальности — это третий регион
России по численности татарского населения [4].
Вопрос о происхождении и этногенезе татар остаётся открытым.
Цель. Определить частоты аллелей HLA-I
класса MICB в популяции татар, проживающих
в Челябинской области, и сравнить полученные
данные с данными по частотам MICB в основных популяциях, проживающих в данном регионе.
Материалы и методы. Было обследовано 108
татар, 100 русских и 50 башкир, проживающих
на территории Челябинской области. Этническая
принадлежность лиц определялась по официальным документам и данным генеалогического
анамнеза в трёх поколениях. Генотипирование
по MICB осуществлялось полимеразной цепной
реакцией с использованием аллельспецифических праймеров (SSP-PCR). Математическая обработка результатов проводилась с использованием специализированных программ для генетических исследований — Arlequin (v. 3.11) [5] и
DoctorStat [6].
Как видно из таблицы, у татар обнаружено 9 из
10 наиболее распространённых вариантов MICB,
которые встречаются в описанных мировых популяциях. Также можно заметить, что значения
частот генов MICB*003, MICB*004, MICB*005:01,
MICB*005:02 и MICB*013 у татар занимают промежуточное положение между частотами данных
генов в русской и башкирской популяции с незначительным отклонением в ту или иную сторону.
Носительство аллельных вариантов MICB*002 и
MICB*008 незначительно выше, чем в остальных
рассмотренных популяциях.
Однако есть и некоторые достоверные отличия.
У татар по сравнению с русскими, как и у башкир,
достоверно ниже частота MICB*005:03. По сравнению с башкирами у татар достоверно ниже
частота MICB*009N и полностью отсутствует
MICB*014, что сближает их с русскими. Таким
образом, основываясь на наших предыдущих исследованиях по распределению частот генов HLA
среди основных популяций Челябинского региона: русских [7] и башкир [7; 8], а также по результатам данного исследования, можно заключить,
что татары Челябинской области несут в себе
35
Частоты генов HLA-MICB в популяции татар в сравнении с другими популяциями...
Распределение частот аллелей MICB среди русских, татар и башкир,
проживающих на территории Челябинской области
Частота генов, %
Аллель MICB
Точный двусторонний критерий Фишера
Русские
N = 100
Татары
N = 108
Башкиры
N = 50
Татары
и русские
Татары
и башкиры
Русские
и башкиры
MICB*002
14,0
18,2
17,5
–
–
–
MICB*003
4,6
1,8
1,0
–
–
–
MICB*004
24,5
18,2
12,8
–
–
P < 0,05
MICB*005:01
2,0
0,5
–
–
–
–
MICB*005:02
37,6
48,4
49,0
–
–
–
MICB*005:03
6,2
0,5
–
P < 0,01
–
P < 0,01
MICB*008
6,2
8,1
5,1
–
–
–
MICB*009N
0,5
2,3
8,3
–
P < 0,05
P < 0,01
MICB*013
3,6
0,9
–
–
–
–
MICB*014
–
–
4,1
–
P < 0,01
P < 0,05
черты как монголоидных, так и европеоидных
популяций.
Выводы и заключение. 1. У татар Челябинской
области по сравнению с русскими данного региона достоверно понижена частота MICB*005:03.
2. У татар Челябинской области по сравнению
с башкирами данного региона достоверно ниже
частота MICB*009N и MICB*014.
Список литературы
1. Collins, R. W. M. Human MHC class I chain
related (MIC) genes: their biological function and
relevance to disease and transplantation // Europ. J. of
Immunogenetics. 2004. Vol. 31. P. 105–114.
2. Stastny, P. Introduction: MICA/MICB in Innate
Immunity, Adaptive Immunity, Autoimmunity, Cancer, and in the immune response to transplants // Human Immunology. 2006. Vol. 67. P. 141–144.
3. Vavilov, M. N. HLA and MICB alleles in ancestral haplotypes in Russian and Bashkir populations
of the Chelyabinsk Region of Russian South Urals
/ M. N. Vavilov, T. A. Suslova, A. L. Burmistrova,
C. Darke [et al.] // Tissue Antigens. 2012. Vol. 79,
№ 6. P. 531.
4. Всероссийская перепись населения 2002
года [Электронный ресурс]. URL: http://www.
perepis2002.ru
5. Arlequin ver 3.11. An Integrated Software for
Population Genetics Data Analysis [Электронный
ресурс]. URL: http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3
6. Компьютерная программа DoctorStat [Электронный ресурс]. URL: http://doctorstat.narod.ru/
index.html
7. Suslova, T. A. HLA gene and haplotype frequencies in Bashkirs, Russians and Tatars, living in the
Chelyabinsk region (Russian South Urals) / T. A. Suslova, A. L. Burmistrova, C. Darke [et al.] // Intern. J.
of Immunogenetics. 2012. Vol. 39. P. 394–408.
8. Суслова, Т. А. Распределение генов, гаплотипов HLA в популяции башкир, проживающих
в Челябинской области / Т. А. Суслова, А. Л. Бурмистрова, М. С. Чернова [и др.] // Иммунология.
2011. № 2. С. 65.