Кодоны аминокислот - zvezda

реклама
Генети́ческий код - это свойственный всем живым организмам
способ кодирования аминокислотной последовательности
белков при помощи последовательности нуклеотидов. В ДНК
используется четыре нуклеотида — аденин (А), гуанин (G),
цитозин (С), тимин (T), которые в русскоязычной литературе
обозначаются буквами А, Г, Ц и Т. Эти буквы составляют
алфавит генетического кода. В РНК используются те же
нуклеотиды, за исключением тимина, который заменён похожим
нуклеотидом — урацилом, который обозначается буквой U (У в русскоязычной литературе). В
молекулах ДНК и РНК нуклеотиды выстраиваются в цепочки и, таким образом, получаются
последовательности генетических букв.Для построения белков в природе используется 20
различных аминокислот. Каждый белок представляет собой цепочку или несколько цепочек
аминокислот в строго определённой последовательности. Эта последовательность
определяет строение белка, а следовательно все его биологические свойства. Набор
аминокислот также универсален для почти всех живых организмов.Реализация генетической
информации в живых клетках (то есть синтез белка, кодируемого геном) осуществляется при
помощи двух матричных процессов: транскрипции (то есть синтеза иРНК на матрице ДНК) и
трансляции генетического кода в аминокислотную последовательность (синтез полипептидной
цепи на матрице иРНК). Для кодирования 20 аминокислот, а также сигнала «стоп»,
означающего конец белковой последовательности, достаточно трёх последовательных
нуклеотидов. Набор из трёх нуклеотидов называется триплетом. Принятые сокращения,
соответствующие аминокислотам и кодонам, изображены на рисунке.
Свойства генетического кода
1. Триплетность — значащей единицей кода является сочетание трёх
нуклеотидов (триплет, или кодон).
2. Непрерывность — между триплетами нет знаков препинания, то есть
информация считывается непрерывно.
3. Дискретность — один и тот же нуклеотид не может входить одновременно
в состав двух или более триплетов.
4. Специфичность — определённый кодон соответствует только одной
аминокислоте. (Свойство не является универсальным. Кодон UGA у
Euplotes crassus кодирует две аминокислоты - цистеин и селеноцистеин)[1]
5. Вырожденность (избыточность) — одной и той же аминокислоте может
соответствовать несколько кодонов.
6. Универсальность — генетический код работает одинаково в организмах
разного уровня сложности — от вирусов до человека (на этом основаны
методы генной инженерии)
Таблицы соответствия кодонов и аминокислот
Генетический код, общий для большинства про- и эукариот. В таблице приведены все 64 кодона и
указаны соответствующие аминокислоты. Порядок оснований — от 5' к 3' концу мРНК.
2-е основание
U
C
A
G
UUU
(Phe/F)Фенилаланин
UUC
U
(Phe/F)Фенилаланин
UUA (Leu/L)Лейцин
UUG (Leu/L)Лейцин
UCU (Ser/S)Серин
UCC (Ser/S)Серин
UCA (Ser/S)Серин
UCG (Ser/S)Серин
UAU (Tyr/Y)Тирозин
UAC (Tyr/Y)Тирозин
UAA Ochre (Стоп)
UAG Amber (Стоп)
UGU (Cys/C)Цистеин
UGC (Cys/C)Цистеин
UGA Opal (Стоп)
UGG
(Trp/W)Триптофан
CUU (Leu/L)Лейцин
CUC (Leu/L)Лейцин
C
CUA (Leu/L)Лейцин
CUG (Leu/L)Лейцин
CCU (Pro/P)Пролин
CCC (Pro/P)Пролин
CCA (Pro/P)Пролин
CCG (Pro/P)Пролин
CAU (His/H)Гистидин
CAC (His/H)Гистидин
CAA (Gln/Q)Глутамин
CAG (Gln/Q)Глутамин
CGU (Arg/R)Аргинин
CGC (Arg/R)Аргинин
CGA (Arg/R)Аргинин
CGG (Arg/R)Аргинин
ACU (Thr/T)Треонин
ACC (Thr/T)Треонин
ACA (Thr/T)Треонин
ACG (Thr/T)Треонин
AAU (Asn/N)Аспарагин
AAC (Asn/N)Аспарагин
AAA (Lys/K)Лизин
AAG (Lys/K)Лизин
AGU (Ser/S)Серин
AGC (Ser/S)Серин
AGA (Arg/R)Аргинин
AGG (Arg/R)Аргинин
GCU (Ala/A)Аланин
GCC (Ala/A)Аланин
GCA (Ala/A)Аланин
GCG (Ala/A)Аланин
GAU (Asp/D)Аспарагиновая
кислота
GAC (Asp/D)Аспарагиновая
кислота
GAA (Glu/E)Глутаминовая
кислота
GAG (Glu/E)Глутаминовая
кислота
GGU (Gly/G)Глицин
GGC (Gly/G)Глицин
GGA (Gly/G)Глицин
GGG (Gly/G)Глицин
1-е
AUU (Ile/I)Изолейцин
осн
AUC (Ile/I)Изолейцин
ова
AUA (Ile/I)Изолейцин
ние A AUG
(Met/M)Метионин,
Start[2]
GUU (Val/V)Валин
GUC (Val/V)Валин
G
GUA (Val/V)Валин
GUG (Val/V)Валин
Обратная таблица (указаны кодоны для каждой аминокислоты, а также стоп-кодоны)
Ala/A
GCU, GCC, GCA, GCG
аланин
Arg/R
аргинин
Asn/N
Leu/L
UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG
лейцин
CGU, CGC, CGA, CGG, AGA,
AGG
AAU, AAC
Lys/K
AAA, AAG
лизин
Met/M
AUG
аспаргин
Asp/D
Метионин
GAU, GAC
Аспаргиновая
кислота
Cys/C
UGU, UGC
CAA, CAG
GAA, GAG
GGU, GGC, GGA, GGG
CAU, CAC
Thr/T
ACU, ACC, ACA, ACG
Trp/W
UGG
Tyr/Y
UAU, UAC
тирозин
AUU, AUC, AUA
изолейцин
START
UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGC
триптофан
гистидин
Ile/I
Ser/S
треонин
глицин
His/H
CCU, CCC, CCA, CCG
серин
Глютаминовая
кислота
Gly/G
Pro/P
пролин
глутамин
Glu/E
UUU, UUC
фенилалацин
цистеин
Gln/Q
Phe/F
Val/V
GUU, GUC, GUA, GUG
валин
AUG
STOP
UAG, UGA, UAA
[править] Вариации стандартного генетического кода
Первый пример отклонения от стандартного генетического кода был открыт в 1979 году при исследовании генов
митохондрий человека. С того времени было найдено несколько подобных вариантов [3] включая многообразные
альтернативные митохондриальные коды,[4], например, прочитывание стоп-кодона УГА в качестве кодона,
определяющего триптофан у микоплазм. У бактерий и архей ГУГ и УУГ часто используются как стартовые
кодоны. В некоторых случаях гены начинают кодировать белок со старт-кодона, который отличается от обычно
используемого данным видом[5].В некоторых белках нестандартные аминокислоты, такие как селеноцистеин и
пирролизин вставляются рибосомой, прочитывающей стоп-кодон, что зависит от последовательностей в иРНК.
Селеноцистеин сейчас рассматривается в качестве 21-й, а пирролизин 22-й аминокислот, входящих в состав
белков.Несмотря на эти исключения, у всех живых организмов генетический код имеет общие черты:
кодон состоят из трёх нуклеотидов, где два первых являются определяющими, кодоны транслируются
тРНК и рибосомами в последовательность аминокислот.
Скачать